Recombined Template REC-0-4_002

Consensus Sequence

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDLTLTISTLLPEDFATYYEQQYNLYPTFGQGTKLEIKREPKASLAPSVFLFPPSDEQLKANKATLVGLVSDLPYQVSLNDKALTSPVVVAGEFDQGSKSSDDRPAASSYLSLTLEQQKSVVSFSVEVTHEGSWVEKTGAANERS

Annotated Consensus Sequence

ConsensusTemplate

CDR1QQ

CDR2AA

LFL

TST

LQL

ECE

CDR3QQ

LSL

LVL

RGR

EQE

S.S

L.L

FTF

DSD

QEQ

KQK

GCG

VIV

LFL

PYYPPY

QGAQ

SLTVSL

NAN

DWD

LDL

TST

VKV

VAGAGVVAG

FTF

DTD

QTQ

GPG

SQS

DND

RKR

PYP

LPL

QWQ

VHV

VRV

FYF

VCV

EQE

WTW

GVG

APA

NTN

RCR

Legend

CDRConservedPossible glycosylation site

Sequence Consensus Overview

GVPM

SGT

LES

QLP

PGLVT

TSA

VLS

SGD

PSMR

LQT

AQL

YLT

QAMDLC

GLELPAR

VATG

NTLSA

SADG

VSL

GQALSW

SEGW

VGY

ESGLKE

DKA

PLETS

SKL

CLTDY

DPA

TLCFS

SCAL

GAQ

GSDK

GVA

GLSP

TSRS

GLCRA

VLGMF

ADGS

LQTG

GATSGS

LGA

TGPS

TLPSG

VEDSPNLT

GLCD

DSNFL

ADT

ETDLS

SLDTLT

SLA

QTL

QNLAP

LGE

LYKF

KQRT

EQDKY

TEY

LCDHEQC

ETKLQA

SALQ

TQAY

KLN

RMYTSL

PRLGY

NYP

GSA

GPTE

LKGK

LQPVGRA

QKLVPRNE

TMVGP

STYLK

NRATG

ATSA

LQA

FRAS

FLSV

PDSL

KGPF

KVES

FQDE

EGHQ

NFK

NREDAQG

RGGGDNA

WNAGEK

WATA

VTA

CSG

MLV

GMWD

PTVFGL

DSPY

DKMSPA

EGQ

ECMVHAA

VTSL

LASVA

GTQAN

TVDSPGD

VENPGK

LTFPVA

WRFDL

QST

FPTS

VGDP

LKYRTV

SALNVAG

SLGA

SGELVA

NDMPTF

RAGTD

ATVLQ

VPG

PETLS

PVAK

QPWTDS

TEAS

LND

PND

GNVLKFR

QLAP

LFGSA

LAGT

LQFSA

DPRTS

DVPQKLY

DNFPLSL

GVESA

KDNGL

GWDPLT

VDNRPAL

NDVE

NGSYLQ

MKWQ

LVYS

LADKV

PVS

CVASDF

VTS

MSCQV

STPQEVAG

GVA

EVT

QVYWFARH

FLKQE

YNLS

FSTWSL

EASMVA

DVQESVA

QGVAKA

DSELTSL

LSTFAVGA

PEA

DTN

GER

GRS

0	E	1	0		1	0	D	1	16.032243227155732
1		1	0	L	1	21.04313982215982
2		1	0	C	1	0.99353	T	1	0.9997	Q	1	17.40312870539371	MQ	2	0.5374708333333333
3	Q	1	0	L	1	0		1	0	E	1	0.252	S	1	0.34098	A	1	0.48604	C	1	0.53379	F	1	0.6323	G	1	0.99407	V	1	1.0251000000000001	P	1	1.70818	M	1	11.222774015444015
4		1	0	D	1	0.4245	A	1	0.6351	L	1	0.84922	S	1	2.13847	G	1	2.28405	T	1	13.052493856908857	QT	2	0.75864
5		1	0	L	1	0.18202	H	1	0.285	A	1	0.304235	GA	1	0.504845	E	1	0.79966	S	1	2.89457	Q	1	12.948878119515621
6	H	1	0.32122666666666666	Q	1	0.32661999999999997	R	1	0.34753	V	1	0.68298	N	1	0.96512	L	1	1.3214299999999999	E	1	1.42985	S	1	20.670338476073482
7	T	1	0	M	1	0.32971	S	1	0.64931	K	1	0.89293	F	1	0.99988	A	1	1.2877933333333333	Q	1	1.89001	L	1	2.36063	P	1	19.969831360711357	SP	2	0.754165
8	V	1	0	D	1	0.31135	N	1	0.43596	A	1	0.99926	L	1	1	P	1	1.329325	Q	1	2.29054	S	1	25.797424085644092
9	Y	1	0	N	1	0	V	1	0		1	0	D	1	0.57714	H	1	0.76669	P	1	0.81867	E	1	0.97098	Q	1	0.99705	C	1	0.99996	A	1	1.285868888888889	L	1	1.786265	T	1	3.5939500000000004	S	1	25.825845664677665	TV	2	0.788345
10	A	1	0	V	1	0.0818	R	1	0.13536	Q	1	0.60953	P	1	2.408975555555555	G	1	7.7020599999999995	L	1	27.23940055978706	TV	2	1	VT	2	7.43239775
11	D	1	0.3333333333333333	F	1	0.97129	P	1	0.99775	A	1	0.99933	L	1	1.3248666666666666	Q	1	1.83175	T	1	5.566753333333334	S	1	41.13026500252526	GT	2	0
12	M	1	0	R	1	0.99407	G	1	0.99532	T	1	1.3320666666666665	L	1	1.598744	P	1	1.9996800000000001	N	1	2.2756075	S	1	2.308653333333333	A	1	51.74872363520923	GT	2	0.17907333333333333	SA	2	1.387	TG	2	1.991935
13	M	1	0.3664	A	1	0.9332466666666666	G	1	0.98579	E	1	0.9924	N	1	0.99603	T	1	2.598589	V	1	3.9952	L	1	7.463163333333334	S	1	43.765295056637804	DK	3	0
14		1	0	N	1	0.292165	E	1	0.3251366666666667	G	1	0.333	C	1	0.49981749999999997	H	1	0.6	R	1	0.90713	F	1	0.99977	W	1	0.99986	D	1	1.0334211111111111	L	1	1.53443	T	1	1.99932	Q	1	2.4948086666666667	S	1	3.7808966666666666	V	1	47.42733299603175	GV	2	0.3329266666666667
15		1	0	V	1	0.4680566666666667	E	1	0.79415	A	1	0.79726	D	1	0.9184899999999999	K	1	0.99709	L	1	0.99943	Y	1	1.2666333333333333	N	1	1.5810933333333335	T	1	1.5841720000000001	S	1	1.99966	P	1	6.989005166666668	G	1	40.96864040101009
16		1	0	C	1	0.12512333333333334	T	1	0.33701	A	1	0.49480625	H	1	0.70366	F	1	0.7773077777777777	V	1	0.98812	K	1	1.166165	N	1	1.29037	Q	1	1.3456299999999999	P	1	1.57248	E	1	1.8018033333333334	R	1	1.872128	L	1	1.99884	S	1	3.1926712	G	1	3.5343299999999997	D	1	32.11311963961039	RD	2	0.38548285714285724
17		1	0	C	1	0.20791	A	1	0.30264	E	1	0.32807333333333333	F	1	0.44311666666666666	N	1	0.68985	GL	1	0.73298	V	1	1.3636666666666666	W	1	1.6004514285714286	G	1	1.7298499999999999	L	1	2.1826600000000003	P	1	2.8264310666666668	S	1	3.57814	M	1	4.67701	R	1	27.177590346681093	VR	2	0.7699050000000001
18		1	0	G	1	0	D	1	0.126572	Y	1	0.21199	P	1	0.34633624999999996	L	1	0.48201	M	1	0.5351	Q	1	1	K	1	1.0951766666666667	S	1	1.26684	R	1	1.65465	H	1	1.73053	A	1	1.8255666666666666	V	1	30.13718257631258	SL	2	0.7996317857142857	LS	2	1.386765
19		1	0	V	1	0	C	1	0.39330999999999994	R	1	0.72313	E	1	0.7791133333333333	F	1	1.01477375	D	1	1.2128966666666667	S	1	1.67908	K	1	1.7082000000000002	G	1	1.99682	P	1	1.9998900000000002	L	1	2.1985	Q	1	6.346864285714286	T	1	23.561966650854703
20	T	1	0		1	0	S	1	0.73493	N	1	0.98838	P	1	0.99967	H	1	0.99991	V	1	1.19515	G	1	1.2273	A	1	5.735134	Q	1	6.7665290476190485	L	1	24.397059842857143
21		1	0	K	1	0.33088666666666666	D	1	0.45069	F	1	0.46459	R	1	0.6940976000000002	G	1	0.9277	M	1	0.93344	P	1	1	A	1	1.12376	V	1	1.33094	N	1	2.0376333333333334	Y	1	2.953118	L	1	3.3284066666666665	T	1	25.191653634004886
22		1	0	G	1	0.17461000000000002	N	1	0.33134	R	1	0.52855	T	1	0.99021	Q	1	1.9454500000000001	A	1	2	M	1	2.0690066666666667	D	1	2.4476666666666667	L	1	6.078510476190476	C	1	13.669560968559221
23		1	0	N	1	0.14487	V	1	0.30907	H	1	0.8428899999999999	G	1	0.94801	F	1	0.95186	GL	1	1.075441	E	1	1.98015	L	1	2.10538	P	1	2.90816	A	1	4.286630000000001	R	1	5.170844273504274
24		1	0	L	1	0.33263333333333334	K	1	0.88336	M	1	0.90923	V	1	3.28948	A	1	38.55253310714285	SA	2	1.76897	GT	2	1.8424166666666668	TG	2	3.4101950000000003
25	Y	1	0.3215266666666667	G	1	0.33768	M	1	0.80418	V	1	0.97295	C	1	0.98933	A	1	1	N	1	2.99672	T	1	4.047673333333333	L	1	4.961070096153846	S	1	35.832305904761895	QS	2	0.982915	GSQ	3	1.8281166666666668
26		1	0	C	1	0.33332333333333336	E	1	0.37472	T	1	0.83007	GA	1	0.9697	R	1	0.97993	F	1	0.99462	H	1	0.99695	N	1	1	V	1	1.7010885096153845	S	1	1.87616	W	1	2.107596666666667	G	1	2.1117	A	1	2.521918888888889	L	1	5.73266	Q	1	29.783711714285715	GGA	2	0.73235	GQ	2	2.589715
27		1	0	R	1	0.26325	T	1	0.68834	V	1	1	L	1	1.25666	W	1	1.79314	Q	1	1.91547	P	1	2	S	1	2.53282	A	1	2.67982	D	1	5.20885	G	1	29.013405837606832	LG	2	1.513135
28		1	0	G	1	0.45806	Q	1	0.48503	P	1	0.99996	W	1	1.83175	V	1	3.2662	S	1	4.130129999999999	L	1	41.18335982554945	VT	2	0.99085	SL	2	1.558955
29		1	0	N	1	0.45728	V	1	0.48421100961538455	E	1	0.94968	P	1	0.97986	L	1	1	Q	1	1.7169466666666668	G	1	1.75826	A	1	2.5814516666666663	D	1	5.09056	S	1	42.13395171428569
30		1	0	E	1	0.6393	L	1	0.7135122222222221	W	1	0.74581	H	1	0.76043	N	1	0.83298	D	1	0.96972	A	1	0.99203	G	1	1	V	1	1.06929	Q	1	1.9366400000000001	T	1	3.3911	S	1	46.486104334249085
31	VC	1	0		1	0	T	1	0.23851	V	1	0.52617	Y	1	0.82445	F	1	0.99962	C	1	0.99988	R	1	1	M	1	1.13672	N	1	1.2166700000000001	E	1	1.91528	G	1	3.2095000000000002	Q	1	3.232806666666667	A	1	4.46612	L	1	4.96736	S	1	5.971480000000001	W	1	25.244753270146518
32		1	0	Q	1	0.61437	P	1	0.7738488888888888	V	1	0.99597	S	1	0.99924	D	1	1	L	1	54.6479453979354
33		1	0	G	1	0	K	1	0.4665	N	1	0.9741	S	1	2.97227	A	1	50.53707588455986
34		1	0	L	1	0.30984	AM	1	0.60418	DS	1	0.964545	K	1	0.99084	R	1	0.99207	SD	1	1.4322750000000002	S	1	2.91136	E	1	3.43744	G	1	3.99508	W	1	35.48744886147186
35		1	0	L	1	0	S	1	0.48264	Q	1	0.82812	F	1	0.98777	V	1	4.54154	G	1	5.29565	Y	1	35.9693315064935
36		1	0	P	1	0	E	1	0	M	1	0.47282	AA	1	0.58029	S	1	0.9846	K	1	0.9997	A	1	1.7793999999999999	Q	1	39.21947772294373
37	H	1	0		1	0	W	1	0	K	1	0.08161	Y	1	0.13813	F	1	0.48198	GA	1	0.654205	R	1	0.67821	A	1	0.8183199999999999	S	1	0.90865	L	1	0.99595	E	1	0.99621	Q	1	36.59403297835497	KQ	2	0.53573
38		1	0	P	1	0.06442	Q	1	0.18261	G	1	0.464784	V	1	0.92753	M	1	0.98467	A	1	1.99094	K	1	43.97674167099568
39	Q	1	0.18266	D	1	0.41498	S	1	0.594238	M	1	0.66418	W	1	0.99956	K	1	1.81023	L	1	2.8788	P	1	44.31664827056275	KPE	3	0.65471
40	P	1	0.49989	W	1	0.5318959999999999	H	1	0.59408	G	1	0.82714	Q	1	1.03428	E	1	33.32596504761906	GSL	2	0.62434	VSA	2	0.6867966666666666	SGL	2	3.6605966666666667	KE	2	3.693906818181818
41	H	1	0.07258	M	1	0.1842	V	1	0.40688	W	1	0.575302	N	1	0.93309	P	1	0.99129	L	1	0.99783	Q	1	1	D	1	1.94834	K	1	24.97890426190477
42	L	1	1	G	1	1.4823225	A	1	40.748234891774885
43	F	1	0	G	1	0.46885	L	1	0.4817	M	1	0.6856666666666666	T	1	0.9119	N	1	0.97733	E	1	0.99479	S	1	1	D	1	1.75069	Q	1	3.98811	P	1	30.501038748917747
44	LG	1	0	D	1	0.44325	R	1	0.92466	N	1	0.98537	L	1	1	M	1	1.26125	A	1	1.93283	G	1	2.588198	K	1	36.04959818831169	SK	2	0.20691
45		1	0	D	1	0.41832	K	1	0.86383	G	1	1.0751899999999999	P	1	1.9999799999999999	L	1	2.0209466666666667	E	1	2.52395	T	1	4.33679	S	1	22.77991135483871	VT	2	1.6032799999999998
46	F	1	0	P	1	0.001036	C	1	0.11685	V	1	0.60408	T	1	0.68371	S	1	0.99633	A	1	2.4	L	1	43.15872373271888
47	R	1	0		1	0	C	1	0.33327	W	1	0.43221999999999994	N	1	0.46375	T	1	0.74428	F	1	0.91919	Q	1	0.95559	P	1	0.98829	A	1	1.55914	G	1	1.96659	S	1	5.258648253968255	K	1	6.992819999999999	L	1	42.742884154377876
48		1	0	W	1	0.03405	A	1	0.31940666666666667	R	1	0.48597	P	1	0.6	E	1	0.71529	V	1	0.97371	G	1	0.99979	K	1	1.93966	S	1	3.07476	Q	1	3.08523	C	1	4.87725	L	1	5.95482	T	1	6.799045873015872	D	1	10.88083	Y	1	22.632875437788016	SF	2	0.542855	FS	2	0.5998060000000001	AY	2	2.1664971428571427
49	N	1	0	T	1	0		1	0	Q	1	0.17377	W	1	0.599996	S	1	0.99997	E	1	1.13463	C	1	1.60752	F	1	1.88409	M	1	2.68055	L	1	3.0378866666666666	G	1	3.1402566666666667	D	1	3.75854	P	1	3.98332	A	1	49.33512141284849
50		1	0	L	1	0	Y	1	0	E	1	0	R	1	0.70242	K	1	0.99263	P	1	0.99889	G	1	0.9999	F	1	1.4838099999999999	Q	1	1.566612	T	1	1.6819199999999999	S	1	2.313436	M	1	8.254790000000002	A	1	53.39774413931706	GT	2	1.82122
51		1	0	R	1	0	M	1	0.53317	W	1	0.68644	Y	1	0.97993	A	1	0.99995	H	1	1.00594	D	1	1.27495	V	1	1.599834	P	1	2.9891199999999998	E	1	3.01965	T	1	3.64619	L	1	13.970239999999997	S	1	52.36349867702209
52	R	1	0		1	0	Y	1	0	Q	1	0.83636	P	1	0.99998	G	1	0.99998	E	1	1	M	1	2.15163	N	1	2.583	A	1	3.61615	T	1	5.648376666666667	L	1	5.66721	C	1	5.96502	F	1	6.914528571428571	S	1	64.41424296476036	LS	2	0.76874	VT	2	0.9930399999999999	TV	2	2.268825
53		1	0	T	1	0.21825	V	1	0.36693	K	1	0.39504	F	1	0.56098	R	1	0.56626	P	1	0.64335	M	1	1.2544300000000002	G	1	2.584786	S	1	4.68848	C	1	4.78409	A	1	5.56256	L	1	64.59694613008772
54		1	0	P	1	0.10957	M	1	0.12407	Y	1	0.598032	N	1	0.97521	H	1	1	AA	1	1.115915	D	1	1.36274	E	1	1.65836	G	1	1.99722	T	1	2.55408	A	1	2.56751	K	1	2.6022522222222224	L	1	2.813223333333333	V	1	2.99058	S	1	4.36163	GA	1	14.681055000000002	Q	1	52.80664946362099	NT	2	0.396135
55		1	0	W	1	0	L	1	0	H	1	0.24333	M	1	0.25727	A	1	0.45464	C	1	0.57659	R	1	0.86607	E	1	0.9267333333333334	T	1	1.35896	P	1	1.9657900000000001	G	1	5.339636	S	1	76.96577159591789	GS	2	1.706715	AAT	3	0.6981366666666666	KD	3	2.03173	DK	3	7.278035802521009
56	D	1	0	L	1	0.3892	W	1	0.547368	A	1	0.59059	R	1	0.85806	E	1	0.88704	N	1	0.93126	K	1	0.99943	S	1	1.9461400000000002	Q	1	1.97866	F	1	1.99585	P	1	2.9995499999999997	V	1	3.16491	G	1	80.6330880757764
57		1	0	H	1	0.01041	C	1	0.13168	R	1	0.20621	A	1	0.22522	E	1	0.32561666666666667	Q	1	0.41583	P	1	0.97692	F	1	0.99948	W	1	0.99953	D	1	1.3532199999999999	S	1	1.3603299999999998	T	1	1.8523999999999998	Y	1	1.99045	L	1	3.2782400000000003	G	1	4.637518	V	1	71.74501414489201
58		1	0	Q	1	0	R	1	0	K	1	0.24947	H	1	0.69549	T	1	0.70214	E	1	0.8771566666666667	Y	1	0.97853	F	1	1.9791699999999999	V	1	2.0515	M	1	2.63783	A	1	3.90026	G	1	6.128364166666667	L	1	8.115851428571428	S	1	16.894048	P	1	50.954117746287764
59		1	0	V	1	0	M	1	0.7215	L	1	0.99988	Y	1	0.99998	R	1	1.569788	G	1	2.46283	E	1	3.383313333333333	A	1	3.6454166666666667	T	1	8.23306880952381	S	1	61.02362784311053	RS	2	4.632932361111112
60		1	0	AV	1	0.9870099999999999	K	1	0.98706	A	1	0.9912	Y	1	0.99994	P	1	0.99999	H	1	1.21774	Q	1	1.30461	S	1	1.505576	F	1	1.8253691666666667	E	1	1.96686	D	1	2.3320233333333333	GL	1	2.676405	V	1	2.98473	M	1	3.14006	T	1	3.37284	G	1	4.07796	L	1	6.598674285714286	C	1	7.059480000000001	R	1	25.218605157882653	FR	2	0
61		1	0	H	1	0.35541	D	1	0.39358	W	1	0.60765	Y	1	1.4320166666666667	C	1	1.9725899999999998	A	1	2.38019	P	1	2.54819	V	1	3.9794891428571435	L	1	3.99613	G	1	5.567570000000001	M	1	9.176252	F	1	21.634149279146147
62		1	0	P	1	0.599994	C	1	0.64209	F	1	0.69917	V	1	0.7063	L	1	0.97365	Q	1	0.97735	T	1	1.99378	E	1	2.0044733333333333	A	1	2.163736666666667	D	1	3.87404	G	1	9.26797	S	1	16.344201904761906	GS	2	0.867285
63		1	0	C	1	0	N	1	0.00639	Y	1	0.37905666666666665	F	1	0.70403	A	1	0.93583	P	1	0.98753	S	1	0.99915	V	1	0.99975	W	1	1.2198085714285714	H	1	1.41021	D	1	1.4183999999999999	L	1	1.94981	Q	1	1.99581	T	1	2.91895	G	1	21.008309999999998	SG	2	0.999315
64		1	0	H	1	0.00054	D	1	0.10084	L	1	0.77443	Y	1	0.99156	Q	1	1.04429	E	1	1.1638400000000002	G	1	2.6179	A	1	2.7568099999999998	T	1	2.9737	S	1	25.122772666666666	GS	2	2.714059285714286
65		1	0	Y	1	0.33292666666666665	W	1	0.599882	R	1	0.69829	K	1	0.75245	N	1	0.99492	H	1	0.99763	D	1	0.99967	T	1	0.99975	S	1	1.1075	P	1	1.7294800000000001	L	1	3.87661	G	1	30.095400666666663	SG	2	1.33044
66	A	1	0		1	0	D	1	0.91877	H	1	0.98683	F	1	0.99353	Q	1	0.99483	W	1	1	Y	1	1.2140900000000001	L	1	1.99773	E	1	2.16146	T	1	2.93643	G	1	4.14321	P	1	5.577394	S	1	21.874287714285714
67	H	1	0		1	0	R	1	0.2590625	D	1	0.499834	Y	1	0.54574	W	1	0.597846	F	1	0.8030766666666667	V	1	0.91097	A	1	1.97893	K	1	1.9987499999999998	T	1	2.98167	L	1	3.87507	P	1	3.9735	S	1	5.99272	G	1	16.905936
68	C	1	0		1	0	M	1	0.34583285714285716	G	1	0.50835	Q	1	0.76892	R	1	0.8595	Y	1	0.95824	A	1	1.32982	K	1	1.7794826666666668	V	1	2.34528	E	1	2.8254799999999998	D	1	2.836334	S	1	2.98742	P	1	2.98963	N	1	3.3769966666666664	L	1	4.86739	T	1	15.941576666666666
69		1	0	M	1	0	E	1	0.14716	F	1	0.23038	Q	1	0.60799	A	1	0.68082	K	1	0.97656	N	1	0.99657	H	1	1.0268466666666667	Y	1	1.2415266666666667	R	1	1.3723166666666669	S	1	1.94352	V	1	2.092286	G	1	2.67894	L	1	3.90073	C	1	5.98527	D	1	22.023600856643363
70		1	0	C	1	0.15367	Q	1	0.35826	E	1	0.40066	M	1	0.44554	A	1	0.47624	P	1	0.599858	Y	1	0.6457	W	1	0.90966	V	1	0.97186	T	1	0.99973	K	1	1.37568	G	1	1.71406	D	1	3.64165	S	1	4.474566666666667	N	1	5.228214423076922	F	1	7.4925999999999995	L	1	9.540799294871794
71		1	0	M	1	0.16652	G	1	0.26348	R	1	0.62586	K	1	0.99633	N	1	1.19709	P	1	1.2425700000000002	Q	1	1.334804833333333	S	1	1.9998200000000002	A	1	3.055206	D	1	11.79034653990746	T	1	21.962788677156176
72		1	0	V	1	0	W	1	0.49581	A	1	0.55466	E	1	0.99905	K	1	1	D	1	1.01508	P	1	1.3666628333333333	N	1	1.4013300000000002	S	1	2.20208	G	1	2.5372600000000003	L	1	46.882426448148344
73		1	0	Y	1	0.74281	L	1	0.98893	F	1	0.99054	W	1	0.99316	R	1	0.99858	V	1	1.364212166666667	Q	1	1.5187179999999998	N	1	1.9742799999999998	D	1	11.294925833333336	T	1	38.70510385457526
74		1	0	T	1	0.37566	C	1	0.6	W	1	0.80567	N	1	0.82452	A	1	0.8983	S	1	0.99282	F	1	0.9982	G	1	0.99928	P	1	3.8243158333333334	L	1	50.936914195322224	VT	2	0	SL	2	1.93979
75		1	0	W	1	0	P	1	0.39633	A	1	0.44991	K	1	0.88008	V	1	1.20179	M	1	1.2376691666666666	N	1	1.471	Y	1	1.9074200000000001	G	1	1.99752	E	1	2.7428625	T	1	3.5325100000000003	D	1	5.267246666666666	L	1	8.775340000000002	S	1	24.950044012697827
76		1	0	Q	1	0	R	1	0.33322666666666667	H	1	0.76363	K	1	0.93554	N	1	0.96333	Y	1	0.97865	V	1	1.91261	G	1	2.5986186666666664	S	1	3.3144576666666667	L	1	4.889545984848485	D	1	6.096490000000001	T	1	27.416545263157886	LT	2	4.683985
77		1	0	A	1	0.13612	D	1	0.1452	M	1	0.32961	N	1	0.36517	K	1	0.479305	R	1	0.99578	E	1	0.99784	P	1	0.99998	T	1	1.39365	Y	1	1.95137	F	1	2.254436666666667	S	1	5.311278571428572	L	1	35.41409980320557
78		1	0	N	1	0.578675	W	1	0.65451	F	1	0.71303	R	1	0.94364	P	1	0.98795	A	1	1.2048833333333333	Y	1	1.4670999999999998	G	1	1.98823	Q	1	3.084433	T	1	4.313987142857143	L	1	35.21472021351456
79	Y	1	0	V	1	0.95958	D	1	0.9999	W	1	1.9925	Q	1	2.3114600000000003	N	1	2.5929433333333334	L	1	3.6197800000000004	A	1	7.056306666666668	P	1	23.27768914285714
80	T	1	0	D	1	0.09271	A	1	0.389725	R	1	0.78703	N	1	0.94233	Q	1	0.97082	F	1	0.99092	K	1	0.99961	L	1	1.99993	G	1	5.311638571428571	E	1	24.49466466666667
81	E	1	0		1	0	R	1	0	H	1	0	M	1	0.33252	N	1	0.3329566666666667	S	1	0.81096	Q	1	0.97416	K	1	0.99995	L	1	1.76817	V	1	11.057590476190477	D	1	20.008256666666668
82	T	1	0		1	0	M	1	0	A	1	0.30759	W	1	0.33320666666666665	Q	1	0.94371	N	1	0.98206	S	1	0.99031	H	1	0.99595	R	1	1.1996966666666666	L	1	1.9998	Y	1	4.304491428571429	K	1	5.5106150000000005	F	1	18.262197166666667
83	R	1	0		1	0	G	1	0.17732	K	1	0.29535	L	1	0.99992	A	1	22.075416666666666
84		1	0	M	1	0.31318	N	1	0.81731	L	1	0.85152	Y	1	0.98572	A	1	0.99954	K	1	1.9586999999999999	Q	1	2.8018383333333334	R	1	3.3030857142857144	T	1	11.176155000000001
85		1	0	V	1	0.17623	R	1	0.18503	E	1	0.96049	Q	1	0.97904	D	1	0.98738	K	1	0.99991	Y	1	12.660013333333334
86		1	0	T	1	0.87346	E	1	1.0356566666666667	Y	1	3.95910875
87		1	0	L	1	0.43311	C	1	0.74997875	D	1	0.97495	H	1	0.99904	E	1	1.6566100000000001	QC	2	1
88		1	0	E	1	0.55527	T	1	0.81741	K	1	0.99699	L	1	0.99839	Q	1	2.5936637499999997
89		1	0	S	1	0.66188	A	1	0.99979	L	1	2.22125	Q	1	2.74668875
90		1	0	G	1	0.14696	T	1	0.91742	Q	1	0.99647	A	1	1.97663	Y	1	4.2498137499999995
91		1	0	Q	1	0.51571	R	1	0.52975	P	1	0.77843	K	1	0.98952	L	1	2.64147	N	1	10.684160000000002
92		1	0	R	1	0.8636	M	1	0.87425	Y	1	0.93266	T	1	1.57105	S	1	3.8299425000000005	L	1	5.60411875
93		1	0	P	1	0.99543	R	1	1	L	1	1.4999025000000001	G	1	1.5192999999999999	Y	1	8.425202500000001
94		1	0	T	1	0.4996675	N	1	1.96916	Y	1	2.31283	P	1	7.73815
95		1	0	L	1	0.60839	M	1	1	Y	1	2.7460575	T	1	20.104561849206352
96		1	0	N	1	0.48517	G	1	0.75833	S	1	0.79203	L	1	0.99792	F	1	21.32577728174603
97		1	0	V	1	0.599996	M	1	0.93528	S	1	0.99744	D	1	0.99755	G	1	22.27542302777778	QG	2	0.617621875	AN	2	0.73583	NA	2	0.8867750000000001	AGN	3	0.69772
98		1	0	M	1	0	H	1	0.23746250000000002	T	1	0.66659	W	1	0.94469	E	1	0.947668	Q	1	18.573005246031745
99		1	0	H	1	0	M	1	0.091745	V	1	0.599872	G	1	25.524903519841274	AS	2	0.93909	SA	2	2.344655
100		1	0	S	1	0.77241	D	1	0.78762	T	1	23.88283085714285
101		1	0	Q	1	0.18677	R	1	0.2706266666666666	N	1	0.79556	G	1	0.99604	S	1	0.9974	L	1	1.4484050000000002	K	1	24.36138088095238	LK	2	0.5134
102	K	1	0.99645	S	1	0.99984	L	1	27.91840190476191
103		1	0	K	1	0.20062249999999998	H	1	0.92794	G	1	1.28966	P	1	1.90122	T	1	1.96971	E	1	15.319408313492064
104		1	0	T	1	0.34389	K	1	0.499395	G	1	0.5110783333333334	N	1	0.7497975	P	1	0.97002	L	1	20.612630476190475
105	N	1	0.52372	M	1	0.6629966666666666	R	1	0.99103	L	1	2.1819575	K	1	15.95810843253968	GK	2	1.3206149999999999
106	E	1	0.17967	L	1	0.74965875	Q	1	0.97625	P	1	0.98255	V	1	1.09798	G	1	4.09264	R	1	5.6023314285714285
107		1	0	Q	1	0.74693125	K	1	0.80528	L	1	0.99652	V	1	0.99929	P	1	0.99979	R	1	1.2206366666666666	N	1	1.3081999999999998	E	1	1.74146
108		1	0	T	1	0.48149	M	1	0.6361166666666667	V	1	0.80553	G	1	0.96653	P	1	3.69746
109		1	0	A	1	0.17197	N	1	0.43496	GL	1	0.507115	S	1	0.83924	T	1	0.97223	Y	1	0.9968	L	1	0.99979	K	1	6.911108333333333
110		1	0	D	1	0.05013	L	1	0.37877	N	1	0.95163	R	1	1.6630099999999999	A	1	10.935815999999999	TG	2	2.25811
111		1	0	W	1	0.07957	L	1	0.18984	F	1	0.29266	C	1	0.5710811111111112	A	1	1.22195	T	1	2.0498525	S	1	10.265261587301588
112		1	0	M	1	0.7891	A	1	0.9945	T	1	1	L	1	20.25194957936508
113	T	1	0.60642	R	1	0.68736	E	1	0.98158	K	1	0.99342	L	1	1.86876	Q	1	1.91648	A	1	14.075999198412699	PA	2	0.48539625	PSA	3	0.8886357407407407
114		1	0	C	1	0.37687	G	1	0.49993750000000003	Y	1	0.8886	S	1	0.93282	A	1	2.73026	P	1	16.149180285714287
115		1	0	E	1	0	K	1	0.325445	Q	1	0.49902749999999996	V	1	0.65404	F	1	0.9886	R	1	0.99701	A	1	1.99966	S	1	13.238912095238094
116	T	1	0.99576	A	1	0.99999	K	1	1	F	1	1.4954399999999999	L	1	1.9997	S	1	2.8756716666666664	V	1	13.05844988095238
117	R	1	0.23551	D	1	0.8809127777777779	S	1	0.98935	V	1	0.99882	T	1	0.99908	P	1	0.99965	L	1	0.99971	F	1	16.48737446031746
118		1	0	P	1	0.6748355555555556	D	1	0.8838966666666667	S	1	0.99251	L	1	9.478646285714287
119		1	0	A	1	0	K	1	0.92405	G	1	0.97544	P	1	0.9998	F	1	7.459623761904762
120	Y	1	0.26582333333333336	A	1	0.7628977777777778	P	1	8.554831142857143
121	S	1	1.9998900000000002	P	1	7.187051682539684
122	K	1	0.98832	V	1	1.61952	E	1	2.9572266666666662	S	1	4.384107428571428
123	R	1	0		1	0	S	1	0.29045	V	1	0.777748888888889	D	1	8.837856000000002
124		1	0	S	1	0.13882	W	1	0.22688	F	1	0.7762822222222223	Q	1	0.93422	D	1	0.98423	E	1	6.822369714285715
125		1	0	K	1	0	E	1	0.68617	G	1	0.99999	H	1	1.81764	Q	1	5.320396857142857
126	L	1	10.32491904761905
127	Q	1	0.08215	N	1	1.6454	F	1	1.93003	K	1	3.4515214285714286
128	N	1	0.98088	R	1	0.9997	E	1	0.99975	D	1	2.06356	A	1	2.2717799999999997	QG	2	2.0248841666666664
129	R	1	0.98992	GG	1	1.960505	G	1	2.24309	D	1	3.733692727272727	N	1	9.163809384615385
130		1	0	T	1	0	D	1	0.71179	Q	1	0.74689	P	1	0.9531166666666666	L	1	0.9869	V	1	0.99968	W	1	1.47771	N	1	1.5962399999999999	A	1	2.40303	G	1	2.8732501398601396	E	1	3.55508	K	1	3.95383
131		1	0	E	1	0.15765	Q	1	0.74228	L	1	0.96766	G	1	0.99326	Y	1	0.99997	W	1	6.9178	A	1	12.520508764568763	TA	2	1.573978
132	L	1	0	E	1	0.60225	A	1	0.88391	K	1	1	Y	1	1	S	1	1.4266016666666665	V	1	1.99064	T	1	24.52105203409832
133	V	1	0.98969	Q	1	5.992710000000001	L	1	37.64901696291837
134	A	1	0.40096285714285707	G	1	0.62879	Y	1	0.96711	K	1	0.97753	R	1	0.99772	E	1	0.99956	H	1	0.99997	L	1	1.555174	P	1	2.66636	V	1	36.60481900024461
135		1	0	Q	1	0.2352	H	1	0.41728	R	1	0.5236	D	1	0.96199	V	1	0.99846	F	1	1	T	1	1.7251500000000002	N	1	1.99477	P	1	1.9999500000000001	C	1	3.7297397500000002	S	1	8.33252	G	1	19.89155776553583
136	Y	1	0.00369	V	1	0.0696375	D	1	0.19697	Q	1	0.61682	A	1	0.7139914285714285	S	1	0.88862	M	1	0.99081	G	1	2.99728	L	1	36.25024605975874
137		1	0	A	1	0	P	1	0.8746324999999999	G	1	0.9163	H	1	0.91772	N	1	0.99589	F	1	1.38049	S	1	1.58988	M	1	2.91104	L	1	9.719861666666667	V	1	17.115141436916968	VT	2	0.2840225
138		1	0	V	1	0.7142585714285714	C	1	0.83279	Q	1	0.93169	R	1	0.99962	A	1	1.352038	T	1	1.90735	S	1	27.994262289259257	DS	2	0.65264
139		1	0	S	1	0.33234	K	1	0.64872	C	1	0.76466	E	1	0.91529	A	1	0.9455239285714283	Q	1	1.24352	G	1	1.794764	M	1	1.8340419999999997	W	1	11.291245693074048	D	1	12.390188779761905
140		1	0	K	1	0	A	1	0.2524326666666666	M	1	0.6227540238095238	S	1	1.0444433333333332	P	1	1.99213	T	1	3.094884761904762	V	1	3.948933333333333	F	1	4.49393625	G	1	4.813365357142857	L	1	4.82019	YF	2	0.99097
141		1	0	R	1	0.41273	W	1	0.64103	M	1	0.7107214285714285	A	1	0.813	T	1	0.9933	D	1	3.1819466666666667	S	1	5.986089999999999	PY	2	8.333165000000001
142		1	0	C	1	0.42088	V	1	0.7141685714285714	D	1	0.89692	K	1	0.97625	M	1	1.47257	S	1	3.94533	P	1	7.004220952380953
143		1	0	T	1	1	E	1	1.89392	G	1	9.554960714285711	Q	2	13.945146285714285	LN	3	0.3262816666666667
144	E	1	0.90544	C	1	1	M	1	1.68804	V	1	2.58491	H	1	2.8113333333333332	A	1	4.858429999999999
145	F	1	0.43647	G	1	0.6986	Q	1	0.7122285714285715	Y	1	0.99927	M	1	1.4443933333333332	S	1	3.88422	V	1	21.345359333333334
146	D	1	0.42076	L	1	0.75097	K	1	0.84819	V	1	2.9998	T	1	9.970472857142859	SL	2	12.039026499999999
147		1	0	L	1	0.7783514285714286	A	1	0.99943	S	1	1.9995500000000002	V	1	8.624226666666667	LG	2	0.52951
148		1	0	V	1	0.58136	Y	1	0.97729	E	1	1	G	1	1.95206	T	1	1.9996399999999999	Q	1	5.37686	A	1	6.5539757142857145	N	1	6.975773333333333
149		1	0	L	1	0.3279066666666667	C	1	0.35864	W	1	0.496	A	1	0.7112071428571428	T	1	0.99926	V	1	1.09516	DS	1	1.7464745000000002	P	1	1.99997	G	1	3.7572400000000004	D	1	4.252366666666667
150		1	0	AV	1	0.2830016666666667	M	1	0.69124	Y	1	0.75495	V	1	0.9991	E	1	1.67581	N	1	1.9597471428571431	P	1	1.995	G	1	1.99871	K	1	5.937623461538461
151		1	0	S	1	0	M	1	0.14645	L	1	0.7769099999999999	T	1	0.8070374999999999	F	1	0.99034	P	1	0.99955	V	1	1.88802	A	1	6.183862666666667
152	A	1	0		1	0	G	1	0.3291366666666667	W	1	0.75553	R	1	1.58985	F	1	1.79939	D	1	2.3153900000000003	L	1	4.773034038461539
153		1	0	F	1	0.33305999999999997	N	1	0.99658	Q	1	1.1433499999999999	S	1	8.611502884615383	T	1	9.309313571428572
154		1	0	E	1	0.1858	R	1	0.83583	L	1	0.97557	K	1	0.99719	D	1	1	V	1	1.1645975	F	1	1.2724199999999999	P	1	2	T	1	3.4248700000000003	S	1	13.448144652014653
155		1	0	K	1	0.50102	S	1	0.99997	V	1	1.9856500000000001	G	1	1.99992	D	1	9.112961785714287	P	1	9.232431538461539
156		1	0	P	1	0.62107	E	1	0.93948	V	1	24.99453048351649
157	H	1	0		1	0	P	1	0.99971	L	1	1.70885	K	1	1.9497700000000002	Y	1	1.99669	R	1	2.60817	T	1	4.3808549999999995	V	1	11.838700619047621
158	C	1	0		1	0	Y	1	0.55471	R	1	0.89666	P	1	1	S	1	2.5234	A	1	6.864749999999999	Q	2	0.97135	VQ	3	0.4528241071428572	LN	3	1.3435140384615387	VAG	3	7.918513666666667
159		1	0	Y	1	0.22647	S	1	0.92403	L	1	1.94557	G	1	7.50606
160		1	0	K	1	0.49052	S	1	0.97992	G	1	0.99993	E	1	2.43906	L	1	2.9522	V	1	4.62776
161	A	1	0	T	1	0.14718	G	1	0.58995	Y	1	0.88612	N	1	0.97019	D	1	0.98177	M	1	1	F	1	2.91113	E	1	11.860342595238095	TE	2	1
162	N	1	0.99433	D	1	1	M	1	1.1262400000000001	P	1	1.99994	T	1	3.82346	F	1	7.357903023809523
163	N	1	0.06727	M	1	0.10215	R	1	0.92319	A	1	0.99854	G	1	1.50579	T	1	3.87967	D	1	7.856011166666667
164	P	1	0.04153	R	1	0.6589	A	1	1	T	1	1.0577	V	1	1.14833	L	1	1.99985	Q	1	8.696806166666667
165	V	1	0.99999	P	1	5.50875	G	1	10.906553166666665
166	N	1	0.42906	G	1	0.65226	P	1	0.99157	E	1	0.99697	T	1	0.99993	L	1	0.99997	S	1	11.651604833333334
167		1	0	W	1	0.20579	H	1	0.3451	P	1	0.98844	V	1	0.99979	A	1	2.7337100000000003	K	1	8.898032833333334
168	A	1	0		1	0	R	1	0.30754	E	1	0.38284	Q	1	0.44839	P	1	0.74641	W	1	0.99826	T	1	1	D	1	1.9301249999999999	S	1	2.5749993333333334
169	Q	1	0.00439	M	1	0.3743	T	1	0.8590288333333334	E	1	0.93703	A	1	0.99229	S	1	11.294450000000001
170	A	1	0	R	1	0	S	1	0.16103	T	1	0.4080758333333333	L	1	2.73298	N	1	3.8395099999999998	D	1	4.6881208333333335
171	E	1	0	T	1	0.09592	P	1	0.71624	N	1	1.3967899999999998	D	1	1.9837699999999998
172	S	1	0	G	1	0.62857	N	1	0.84457	V	1	0.98259	L	1	0.98883	K	1	0.99961	F	1	1.40856	R	1	1.8485200000000002
173	Y	1	0.31573	Q	1	0.81944	L	1	0.99967	A	1	1.99932	P	1	3.6476699999999997
174	Q	1	0.13503	N	1	0.40712	L	1	0.48807	F	1	0.99461	G	1	0.99491	S	1	0.99998	A	1	5.453999999999999
175	Q	1	0		1	0	E	1	0.17795	L	1	0.9992	A	1	6.9041	GT	2	1.8955899999999999
176		1	0	L	1	0.60014	Q	1	0.81771	F	1	0.99569	S	1	7.3263
177	K	1	0	D	1	0.99551	P	1	0.99992	R	1	1.9723600000000001	T	1	1.99784	S	1	8.638047499999999
178	D	1	0.99231	V	1	0.9997	P	1	1.1357475	Q	1	1.69584	K	1	1.9246699999999999	L	1	2.7372	Y	1	5.53335
179	E	1	0	S	1	0.00849	W	1	0.413935	A	1	0.77869	D	1	0.9655	N	1	0.96932	F	1	0.99931	P	1	1.9997	L	1	8.80502	SL	2	1
180	T	1	0.62628	G	1	0.93989	V	1	0.99253	E	1	2.493545	S	1	11.787640000000001
181	R	1	0.6	K	1	0.99783	D	1	0.99985	N	1	1.61494	G	1	1.93858	L	1	10.98626
182	Q	1	0	R	1	0	G	1	0.99997	W	1	1	D	1	1.4963425	P	1	1.9999099999999999	L	1	4.59868	T	1	5.82318
183	V	1	0.97868	D	1	0.99974	N	1	1.48824	R	1	1.49622	P	1	1.49997	A	1	1.99973	L	1	4.63138
184	T	1	0		1	0	N	1	0.77327	D	1	0.94268	V	1	0.99977	E	1	4.7077975
185		1	0	N	1	0.4955175	G	1	0.99732	S	1	0.99994	Y	1	1.09802	L	1	1.4999475	Q	1	1.9814
186	R	1	0		1	0	M	1	0.32957000000000003	K	1	1.09729	W	1	1.4403625	Q	1	1.4785825
187		1	0	G	1	0.99999	K	1	5.6517525
188	L	1	0.53001	V	1	0.99978	Y	1	1.9818099999999998	S	1	4.7340599999999995
189	S	1	0		1	0	L	1	0.42217	A	1	0.71555	D	1	0.99945	K	1	0.99987	V	1	1.9748999999999999
190		1	0	N	1	0.08498	R	1	1.9135	V	1	2.77718
191	K	1	0		1	0	P	1	0.47297	V	1	0.9999	S	1	4.05923
192		1	0	C	1	0.44698	V	1	0.52983	A	1	0.6965	S	1	0.76007	D	1	0.99489	F	1	0.99941
193		1	0	V	1	0.96361	T	1	1.3092000000000001	S	1	2.8323733333333334
194		1	0	M	1	0.47361	S	1	0.91542	C	1	0.9377633333333333	Q	1	0.95459	V	1	0.99751
195		1	0	S	1	0.98469	T	1	0.98639	P	1	1	Q	1	1.3292533333333334	E	1	2.91609	VAG	2	0.9996966666666666
196	G	1	1.87931	V	1	8.609471874999999	LS	2	0.3333333333333333
197	A	1	0.23127	E	1	0.98604	V	1	0.99999	T	1	8.43025625
198		1	0	C	1	0.3333333333333333	Q	1	0.46027	V	1	0.55244	Y	1	0.80221	W	1	0.854090625	F	1	0.98306	A	1	1	R	1	1.0453999999999999	H	1	2.99759
199		1	0	F	1	0.88796	L	1	1	K	1	1.1913564583333334	Q	1	1.98819	E	1	2.50712
200		1	0	D	1	0.24957	V	1	1	G	1	6.252325624999999
201		1	0	Y	1	0.58065	N	1	1	L	1	1.78606	S	1	4.6378375
202		1	0	F	1	0.8735375	S	1	0.999	T	1	1.86907	W	1	1.9521	SL	2	1.7095764285714288
203		1	0	E	1	0.40982	A	1	0.98468	S	1	0.99065	M	1	0.99763	V	1	3.3872999999999998
204	D	1	0.79529	V	1	0.89665	Q	1	0.98699	E	1	5.6039200000000005	SGL	2	0	SVA	2	0.6775566666666667
205	Q	1	0.98803	G	1	0.99964	V	1	1	A	1	1.71427	K	1	3.5904300000000005
206	D	1	0.79343	S	1	0.99837	E	1	1	L	1	1.9977399999999998	T	1	2.27983	SL	2	1.714245
207	L	1	0.96733	S	1	0.99203	T	1	0.99557	F	1	0.99984	A	1	0.99996	V	1	1	G	1	1.9755099999999999
208	H	1	0.99996	A	1	5.437041428571428
209	P	1	0.99953	E	1	1.699237142857143	A	1	1.99943
210	D	1	0.54889	T	1	1.1995671428571428	N	1	1.99871
211	E	1	1.14722
212	G	1	0.6583728571428571	E	1	0.88371	R	1	0.95203
213	G	1	0.3318	R	1	0.5513185714285714	S	1	0.98865

Variant Graph

Determine stroke width:

LocalGlobal

Higher Order Variant Graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence

Label	Value
"0"	16
""	21
""	19.9
""	17.2
""	20.1
""	17.9
""	26.1
""	29.1
""	32.2
""	38.4
""	46.6
""	53.2
""	66.8
""	62.1
""	63.6
""	59.4
""	53.7
""	48.6
""	42.6
""	43.6
"20"	43
""	40.8
""	30.2
""	20.7
""	51
""	55.1
""	55.6
""	49.9
""	54.9
""	57.2
""	59.5
""	55.9
""	59
""	54.9
""	51.1
""	48.1
""	44
""	42.9
""	48.6
""	52.5
"40"	45.5
""	32.1
""	43.2
""	41.8
""	45.4
""	37.6
""	48
""	63.4
""	66.7
""	72.3
""	74.2
""	83.1
""	105
""	86.2
""	94.7
""	101
""	97.9
""	90.5
""	96.2
""	87.7
"60"	70.2
""	54
""	41.1
""	37.9
""	40.3
""	44.5
""	44.8
""	41.3
""	44.7
""	45.9
""	39.4
""	44.6
""	58.5
""	59.6
""	63.2
""	54.8
""	54.9
""	50.8
""	51.2
""	42.8
"80"	37
""	36.3
""	35.8
""	23.5
""	23.2
""	16.9
""	5.87
""	5.81
""	5.96
""	6.63
""	8.29
""	16.1
""	13.7
""	13.4
""	12.5
""	24.5
""	24.4
""	28.7
""	21.4
""	29.5
"100"	25.4
""	29.6
""	29.9
""	21.6
""	23.7
""	21.6
""	13.7
""	8.82
""	6.59
""	11.8
""	16.2
""	14.7
""	23
""	22.5
""	21.6
""	18.7
""	22.4
""	22.6
""	12
""	10.4
"120"	9.58
""	9.19
""	9.95
""	9.91
""	9.88
""	8.82
""	10.3
""	7.11
""	9.34
""	18.1
""	20.3
""	24.9
""	31.4
""	44.6
""	46.8
""	41.8
""	42.7
""	36.7
""	35.4
""	32.2
"140"	26.1
""	21.1
""	21.1
""	26.7
""	26.7
""	29.5
""	27
""	27
""	25.4
""	15.7
""	16.3
""	11.8
""	11.6
""	20.4
""	25.3
""	23.8
""	26.6
""	25.5
""	22.5
""	22.5
"160"	22.5
""	20.3
""	16.3
""	15.3
""	14.6
""	17.4
""	16.7
""	14.2
""	8.39
""	14.5
""	11.8
""	4.19
""	7.7
""	7.78
""	9.47
""	9.98
""	9.74
""	14.6
""	15
""	15.9
"180"	16.8
""	17.1
""	15.9
""	13.1
""	7.42
""	7.07
""	4.35
""	6.65
""	8.25
""	5.11
""	4.78
""	5.53
""	4.43
""	5.11
""	4.28
""	8.22
""	10.8
""	10.6
""	9.03
""	7.57
"200"	7.5
""	8
""	7.4
""	6.77
""	8.96
""	8.29
""	8.78
""	7.93
""	6.44
""	4.7
""	3.75
""	1.15
""	2.49
""	1.87

Scores

Length	Score	Matches	Unique Score	Unique Matches
214	3.99E+04	724	0	0

Order

IGKV1D-16 → IGKJ1 → IGLC2

Alignment

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200

DIQMTQS-PSSLSASV-GD-R--VTITCRAS-QGI-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K-APKSLIYAASSL-Q--SGV-PS-R---FSGS--GSGT-DF---TL--T--I-S---TLL-PEDFATYYCQQYNSYP-TF-GQ-GT-KLEIKGQPKASL-A-PSVFL-FPPEDEHLFANK-A-TLVCLIS---DFYPGAVTVAWKAD--SSP-VKAGVET---TTPSKQSNNKYAASSYL-SLTPEQWKSHRSYSCQVTHE--GSTVEKTVAPTECS

A-ALGHSGQ---DFW--AVVVA--------------GEF---DQGSKESS KAGD-W-TLVGLVS---WGSSGMST--------STPGVRAY TL-V---GV-LS-------GE--GSST-CS---T--------S---TPG-VRSF GGE-W-TLVGLVS---WGSSGMST--------STPGVRAY KQ--WDT-LV-GL---VSGE--GSST-C-------------S---TST-PGVYAR SATTVT---NTVD-PS-Q---DDFA--GTTS-DT---TG--W--G-L---TRY S-LDL-D-SL--LA-----E-VKG---M-GDKDL--AQSSL-K SNA-W-TLVGL--------PGVMTLVGNAW--TPG-VY GV-LT-L---VSWG--SSGM---------------S---TST-PGVYAR GV-LT-L---VSGQ--GSST-C-------------S---TST-PGVYAR GV-LT-L---VSGE--GSST-C-------------S---TST-PGVYAR NG-AWTLVGLV-------DGVGLVAGNAW--TPG-VY V-LT-L---LSGQ--GSST-C-------------S---TST-PGVYAR K-L-EVHCGVS---C---GAVVVAGEMDQGSSS-EK PE-D---FA-------T-YS---TL--T--P-E---DFA-PEDFATY QLL-S-SR--D---------PE---Q-ASLPLLSGGTN AE-D---FATY--PEPE-DF---A------------TTY-PEDFATY AE-D---FATS--PE---DF---A------------TSQ-PEDFATY WTLL-QE-------------------Q-GT-K NA-W-TLVGLLS---WGSSTCSTSTPGVR--SF S-ASAPSAS--------------AS-QPS-A-SN DLSNSV-TV-S--VT-----S-STL-S-SN--VAK-S GGE-W-TLVGLVS---WGSSGMSTSTPGVR--SF NSL--TL-G--GD-NLTLLG--KATL-T-SF KLDAMLSS-GA--SGV-SS-C---MGDS--GGPL-KA---M LKDAMLSS-GA--SGV-SS-G---GCGA--GYLL-HC GSA-PS-A---PSGT-----D-DF---AA--T--T-T---TTG-W LQGQTL-PL-LSNTD-G--------TDHAS NNDL--T--L-S---LTL-LKK---------NSYN GV-LT-L---VGSE--GSST-CS---TS--T--P-G---VYR-A LKDAMLCA-Q--SGV-SS-C---M-GD--GSGP-L KLDAMLSS-GA--SGV-EM-M---GDSG--GPLK-AM ADGEA-VLVPGSS---MPSMQVSLQDK ADDE-A-VLVPGSS---MPSMGAVSLQDK LKDAMLCA-Q--SGV-SS-S---CSCL--KLHC AGV-Y-TLVGL------SWPGVYTLGVM ADDE-A-VLVPGSS---MPSMQVSLQDK LGLMADML-Q--SGV-SS-C---MGNS--GGPL YNS-------------LTLKGLTYNSM SGTA----SVVSSTMEVTHQ--GL SD-VVVAGEM---DQGS--STDKLGA ELENYHTL-L--EGG-QE-D---FQSS--GAGK ELETYHNL-L--EGG-QE-D---FQSS--GAGK RAL-EDL-E-DA--L----Q-GA-AKE---D-ALR TLEEEREL-L--EGG-QE-D---FQSS--GAGK YN-SLTLNGKKL-------VTHF T--L-S---LTL-NNDLLKK-----NSYN SGTA----SVVSATMEVTHQ--GL AE--DFAT-YQ---PE--D--F-A---TAQ-PEDFATY SD-VVVAGEF---DQGS--STDKLGA AGA--SGV-MM-M---GDGS--GPGK-EK---KD--Q--W SA-WAW-S-AG--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK AS-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KP---SGL-APK AS-QGL-S-SSMLSSDS-GM-K-KPE---K-APK TLVGL-V--SGD-HS-S---CSTS--TPGV-SF---R AS-QGL-S-SW--LAG-QS-FWKP---SGL-APK AS-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK WAS-QW----SA--LAW-YQ-Q-KPK---E-APK DLCSLQS-PSSLSGSL-GD-L--SRL DLQMTQS-PSSLSASV-GD-R--LSL SKAEAESYLQSKYE-ELQLTQR Q-GSW---W-APGSPWPWQVSL-Q--DK GSLGGGFSS------GG-FS-R---FGGS--S SDVVVSSSGAQE--GSSSEKLGA AS-QGL-S-SW--LAW-GA-QYKP---SGL-APK VGECLLCA----Q--SGV-SS-C---MGDS--G GS-GG-R---GSGG--GLGS-GG---SL--R--S-S---Y GSETVSETVPSA-SDNFAAGTTKL NL--D--L-S---DLL-AEVAKAQYEELAQR SA-QGL-S-SW--LAW-GA-QYKPE---K-APK AS-QGL-STST--QSSD-YQ-Q-KPE---K-APK AS-WAW-G-TG--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK LQ--QS-SPPRQASL-PP-L--LSNT TG-QGL-S-SW--LAW-GQ-AYKP---SGL-APK AS-QGL-S-SW--LAW-QQ-Y-KPE---K-APK AS-QGLAS-SM--LSSD-YQ-Q-KPK---E-APK AS-QGL-S-SW--LAW-GQ-AYKP---SGL-APK GT-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KP---GSL-APK AS-QGL-S-SW--LAGQYQ-Q-KLQ---N-APK AS-QGL-S-SW--LAG-QP-HWKP---SGL-APK AS-QGL-S-NY--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK S-LDL-D-SL--LAE-VQ-R-PDE---HLAQK SETVTE---TVPSA-SDDFAAGTTKL NL--D--L-D---SLL-AELKAQEYEQLGR S-LDL-D-SL--LAE-VQ-Q-QQH---VLAQK SG-SQL-S-QQ--LASVYQ-Q-KPE---K-APK LDF---SE--F--L-S-----L-LGDLATDYHK LQQG----TLP-LLS---DTDPGHM L-GLTLVSWGSARPCSCPGVY SM-TGL-S-QQ--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK S-LDL-D-SL--LAE-VAA-S-KME---DLAQK S-LDL-D-SL--LAE-VKAQ-MME---L-AQK LDF---TD--F--L-S-----L-LGDLATDYHK SL--D--L-S---LDL-AEVKAQYEDLAQK S-AWS-Q-WA--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK SGTASV-------VTGTMEVTHQGL KYCADMC-S--SGV-SS-C---CGHE--GPL SS-QGL-P-VM--LAGEYQ-Q-KPE---K-APK GGE-DFA--TW--N--P-E---DFATPEDFATYY TSD-VVVAGEF---DQGSK-SDT GVTTV-D--SVV-AG-E---FDQG--SSKT-D ASS-----SSY-PS-L---LQHS--GSGN LVQDHC---GVTCGAVVVAGEF TLARALV---DGMVQQTLAAN AGEVDV----D--QEV-VVAGEF DLQMTQS-PSSLSASS-PS-R AS-GQL-S-SSV-LAGEYQ-Q-KPE---K TG-QGL-S-SSV-LAW-YQ-Q-KPE---K GP-VY---DL--Q--L-L---LLL-QLDNAR GVTTSD-VVVAGEF---DQGSKDST DLQMTQS-PSSLSASV-GR-D TG-GQL-S-SSV-LAW-YQ-Q-KPE---K V-GE-C----LLC-AQ-SGV-S-SC SLAFL-A-PSVF---PPSDEQLK AS-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K TG-GQL-S-SGE-LAW-YQ-Q-KPE---K TGL-A-PSVFL-FPPSDEQLK LQMASE-PSSLSASV-GD-R AS-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KKP---E KGMELLCA-----GA--SGV-SS-C---M TSD-VVVAGEF---DQGSKDST DLQMTQS-PSTVSASV-GD-R SDVVVAGEFE--DSTEEKLGA AS-GGAL-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K CL-L-CVVVS-GPPVDEQLKDN SL-L--EG----------EGS--SGGN-R AS-QGL-S-SSM-LAAM-YQ-Q-KPE---K DLQMTGAS-PSSLSASV-GD-R AGA--SGV-SS-S---MGDS--GGPT-RK---G VGVSS-E--TVV-AG-E---FDQG--SSKT-D AS-QSQ-Q--W--LAW-YQ-Q-KPE---K TGL-A-PSVFL-FPPSDQELK SGTASV-------VGSTCEVT-H KTTFVG-SQL-Q--SGV-PS-R---F GT-ASG-Q-QW--LAW-YQ-Q-KPE---K VTTSD-VVVAGET---MQGPHPSN DLQMTQS-PSSLGTSV-GD-R TSD-VVVAGEM---DQGSKSTD GT-QGL-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K DLQFTQS-PSSLSASV-NG-R DLQMTQS-PSSLSSAV-GD-R GMDSV-S-QQ--LAW-YQ-Q-KPE---K-APK AS-QQ--S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K -----L-SSSLSASV-GD-R DLQMTQS-PSSLSASV-GD-R LQGA-G-TLP-LLS---DTDPGHM GSGG-GS-Y---GSGH--GYGG-GS---GG TSK-GA--SVV-SS-T---MEVT--HQGL DLQMTQS-PSSLSASV-GN-R A-YQVSLMS---DVPYQVSLN VTTSD-VVVAGEF---DQGSKDST TSD-VVVAGEF---DQGSKSTD QGMTTSDV-VVAGEMD---GAGSKTSD VTSTD-VVVAGEF---DQGSKDST SL-AAPSVFL-FPPESSHLF SL-AAPSVFL-FPPSDEQLK SLLYAASSL-Q--SGV-PS-F---R ASLAYL-SSL-Q--SGV-PS-R---F QS-Q-L-S-SW--LAW-YQ-Q-KP---VSA NLMGY-TF-ANLGT-KLELKRN NLQMDHS-PSSLSASV-GD-R SL-AAPSVFL-FPPSDEQLQ SLLYAGTTV-Q--SGV-PS-R---F SL-AAPSVFL-FPPSDEKLQ SLLAYASSL-Q--SGV-PS-R---F SASSL-G--GG---------FGGS--RG S-QQL-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K E-P---ATGS--GGGR-FG---TG--T--A-Y QGS-S-S----------Q-KLQ---K-L T-SWV-S-QQ--LAW-YQ-Q-KP---SGL S-SWL-S-QQ--LAW-YQ-Q-KPE---K MADK-LLCAGASG-V--SGT-K SLLYAASTV-Q--SGV-PS-R---F SLLYAASSL-Q--SGV-PS-R---F SD-VVVAGEF---DQGSKDST VTAVV--D-W--VTVTAAAA-N QSANTPP-LS-SQ-AS-QLPL TTPSA-SDDLPSASDDF GSL-G--GGF-SS-GG--FSGS--GSFR MLQVSLMS---DLPYQVSLGG SLLYAASSL-Q--SGV-PR-S---F PEDFATMTL--T--L-S---DFA-PEDFATY MLQVSLFS---DLPYQVSLGG DS-TVVLSM-DKD-L--VPATD SD-VVVAGEF---DQGSKSTD DQGS-S-S----------E-KLE---K-L QS-Q-L-S-SW--LAW-YQ-Q-KPE---K SSGS--SSG----------------S---HLL VTALV-SD-M--VQQTAAAN YLQVSLMS---DVPYQVSLN SVLTLTPAL-Q--HPV-LS-GL SLLSFASSL-Q--SGV-PS-R VTALV-GQ-M--VQQTLAAN KGLTALV-ND-M--VQQTLAAN VCAGAGSKLLCA-----GA--SGV ESRPGPLASSQA-SLPL SQT-VS-AV---CLGS--GY-D-DF T--LSYN-SL---TL--N---SL---TLP-W SLLYAASNT-L--AAT-PS-R SQTVSAV-GT-N--HDLDDF SALQPA--L-Q--MPV-LS-GL AL--NTP-VRASLGT---NLPL SK-VPQVTP---TLVEVRS MLQVSLMS---DLPYQVSLN SLLYAASSL-E--LE--PS-R NLPYGY-TF-GQ-GT-KLELKR KGQVS-S-GE--LAW-YQ-Q-KPE---K NLYPYTF-GQ-GT-KLELKR SLLYAGTSL-Q--SGV-PS-R NLYPYTF-GQ-SA-KLELKR AMDKLLCAAS-------GV PEDFATVTLTLTLTYY SLLYAASS--E--ELL-PS-R E-PATGTSGR-GD-S--VTAY DL-A-PSVFPAFPSVDEQLN ASLLYA-SSL-Q--SGV-PS-R SLLYAASSL-Q--KD-PS-R LQAGAS-LPLLSNTC-GK MLQVSLFS---DLPYQVSLN HNL-L--EGG-QE-D---FESS--GAGK LASLSSSL-Q--SGV-PS-R---F GG-GL--VPALQPVL-RGL-S-S NLYPYTF-GQ-GT-KLEKLR SLLYAASSL-Q--SGV-PS-R SLLAYASSL-Q--SGV-PS-R SLLYAASSL-Q--GSV-PS-R SLLYFREM-----SGV-PS-R TL--T--L-S---TLL-PEDFATY SLNNQFAFSLD-SLLR LLDMELM-GA--SGV-SS-C---M LQQA-SLP-LLS---DTDPGHM PYQVSLMS---DLPYQVSLN PYQVSLFS---DLPYQVSLN LYAASSL-Q--KD-PS-R---F LYAASSL-Q--SGV-PA-R---Y TL--T--L-T---LTL-PDDFATY PYQVSLMS---DVPYQVSLN GLNERPAASL-Q-ASLPL LYAASSL-Q--SGV-PS-R---F DL--T--L-----TLW-PEDFATY KSLKQEMLCA-GA--SGV-S TL--T--L-S---SLQ-PEDFATY DLLYL-SSL-Q--SGV-PS-R S--NDLT-YL---TLNND--L-T---KLL TL--T---VT---LTL-PEDFATY GG--GSTP-VD---DL--D--L-D---DM LLDMELM-Q--SGV-SS-C---M LYAASSL-Q--SRG-PS-V---F S--NDLT-KF---TLNND--L-----TLL NLFNGE-Q-ELVDLNR---DF LSSP------AT---TPPSA VTALVDT---RPPGPWQN DVVVAGEF---DQGSKSTD ELNRPQASSQA-SLPL AVTVA------TVP-VTR PYQVSLFS---DVPYQVSLN ASLYALSSL-Q--SGV-PS-R---F LQQASLPL-L--GEQ-PS-R LYAASSL-Q--SGR-PS-V---F VTAL--VNWVEVEVAAN GSNPRPLASSQS-SLPL VTALVNN---GRPNWQAN A-SLP-LLS---DTDPGHM KD-A--MLLACGAS--GV-S-S S--LPGQ-GS----L--D--L-S---TL S-LNDQFASF-LD-R--VK GSGW-GS-G---WGWS--GWGN LYAASSL-Q--SGV-PS-R KGTLKDAMLCA-GA--SGV PALWPA--L-Q--SPV-LS-GL RVNVPAL--QSP-VLSGL ELS--KSFTLDD---DL--T--L-L PSLNGYN--SYP-SLL DQGS-S-SE--LK-----Q-KL AL--T--L-P---SLF-PEDFATY S-QTV-S-AVC--LAE-QE-H-M SL--T--L-S---TLQ-PEDFATY LTRELVGSWVEQTLAAN L-GA--GGV-PAGR---PVYS--GL YNSLT-LN-GH-MT-LLK GGK-N--VPALQPAL-QGL YNSLT-LN-GM-HT-LLK QVT-------VQKDSA DLDSLL--AENL-T--SGH-M DLQMTQS-PPHVQTM KLDAFLCA-Q--SGV-ME-M YAPSLL-QYSSAC-PS-L---L D--L-D---SLL-AEVKAQYE PYQVSL-M--CGV-PY-Q---VSLG--G G-VD-E--VTLVNLLS-QR TP-S--SSV-PS-S---PSSS--L LYAASSL-Q--SGV-PR-S NLETLLD---SFRPEMVK SL--T--L-T---LTL-PEDFATY TS--T--C-S---TST-PGVYAR YLAASSL-Q--SGR-PS-V---F GSST-CS---TS--T--P-G---VYL EL--T--L-S----LW-PEDFATY S-LNNQFASF-LD-R--VK TAYCLAS-GLG-S-TA EPATGT-GE-R--VTAM TF-GQ-GT-KLELGKR TAYCGLAS-GLG-S-TA LKDAMLC-AA--SGV-SS AAWPAL--QKP-VLSGL D--L-D---SLL-AEVKAQY SASV-GGGR--VTLTCR AASSL-Q--SGV-VR-T---M TL--T--L-S---TLL-PEDFG SASV-GD-R--VTLTCR SASV-GN-R--VTLTCR GL--T--LPE---DFA-PEDFAY V-GL-V--VGLVDRMS-G SASV-GD-R--VLTTCR LAW-YQ-Q-KPE---K-APK LQQ-ASLPLASQ-PD-R DT--L-T---DEL-NFLRALY LKDMALAC-GA--SGV-S TF-GQ-GT-KLELKVN TF-GQ-GT-KLELKRN TF-GQ-GTGKLELKRN EVTVE--G---DKTF PALPCPAL-QPV-L-SG--L FSSSSG-Y--GGG-SS-R GSGD-VP---AL--QPVL-S---GL AASSL-Q--SGV-PA-R---Y LLDMELM-GA--SGV-SS CGVP--AL-Q-PSVRL APK---E-APKEAPKEAY SASV-GD-R--VTLGMR LAW-YQ-Q-KPK---E-APK QASSGSPAT-LV-R--VVL TGSASV-------VTHF VTALV-GC-V--VQQTL GS-SS-RNGCFGGS--SGGY VTALV-DD-M--VQVTL AASSL-Q--SGV-PS-R---F AASSL-Q--SGV-AR-L---M VTALV-AD-M--VQQTL TF-GQ-GTGKLELGKR AASSL-Q--SGV-PR-S---F SASV-GD-R--VTLNMR SPSWV-PS-S---VPGS--WPW GSDK-DL---QP--V--L-S---GL SASV-GD-V--RTLNMR VTALV-SD-M--VQQTL TF-GQ-GT-KLEKLRN QGP-AWTLVGLVS---W SSLL-EKGLDQKK AHSL-Q--DK--T-G---F QSLEASLAETEGR VPGTQ-VS-V--VDLTCR AASSL-Q--SGV-PS-R LKDAMLCA-GA--SGV LRPEPSLSL-E-PR ATCPAL-QPV-L-SG--L TF-GQ-GT-KLEKLR LQP-ER-PSSLPL LKDAMLAC-GA--SGV AASRLL-VDWVEQ LKDAMLCG-AA--SGV EF-DQ-GS-SSELKQK AMAL-YQ-K-QPE---K-APK NLYPYTF-GQ-GT-KL SASV-GA-R--PFLTC TF-GQ-GT-KLELKR E---P-ATGTLNYFAH AASSL-Q--SGV-PR-S AW-YQ-Q-KPK---E-APK TL--T--L-S---SLQ-PEDF NLYP-YFTGQ-SA-KL SASV--D-R--KELTC SASV-GD-S--RLLTC SLSASV-GD-S--LRL GDSGG-PL-G---HGGS--GS ERT-DL---QP--V--L-S---GL NVELDPELQKVKRS QSLEASLAETERG AW-YQ-Q-KPE---K-APK EPSL-Q--DK-GT-H---FF NVELDPELQKVSRK AQGP-W-TLVGLVS---W SASV-GD-V--KELTC AASSL-Q--SGVFPS-R SASV-GD-R--SLLTC YQ-Q-KPK---E-APKVT NS--LTGT-LS---NL--T--L-L VTLTSASSR-P--S KLDMALCA-GA--SGV F-GQ-GT-KLELKR NG-AWTLVGLVS---W AS-GQL-S-SW--LAW QASSGSPSV----R--V SSL-L--RGL-PA-T---L R---FSGS--GSGT-DF APMPALQAFLS FLPPKGPGKDTL E-P---ATGT--GSRT-M AAVTAYCYAD--SL GGN-DL---TL--T--L-S---LL DLQPSSSSPSSL T--L-S---LTL-DNDLL DLQCSLS-PSSL NNVPALQPVL-S TCHAV-LLP-G-SW DLQVSSSSPSSL TF-GQ-GT-LKELK DLQE-QH-MQSL KNW-Q-TLVGLVS---W DLQMGQS-PSSL AG-SQL-S-SW--LAW TF-GQ-GSQKLELK DLMQTQS-PSSL QVTVQDKTG--F SASV-GG-GKVVSGT AVTVATVPL--SR SLSSVV-YH-F--VF SK-AEAESLYQKS KTL--SVP-VTLN SL--D--L-S---DLL-AEVK NL--D--L-S---DLL-AEVK KNW-E-TLVGLVS---W K-AMDLLCAGAS T-LN---DN--L---SL---TLL ANTPTRPAS-QA-SL VVGTAHPDEES SASV-ER-L--VSGT KACL-P-SASDD-F DLTVGQN-KSLL DLQMTQS-PSSL SASV-GD-R--SLLT SASV-DV-R--GTLT DG-AWTLVGLVS---W GFSSGSAVV-SN-R--S GT-KL--KGEML GFSSGSAVVSGG-R--S NNDL---TL--T--L-Y---NSL-L TF-GQ-GT-KLELK NLYPYTF-GQ-GT-K DAFLGSFLYEYSR NQ-W-TLVGLVS---W SL--D---SL---DLL-AEVK KRAL-A-PAATL-K TAAE-ND-F--VTLK ALV-GQ-M--VQQTL SASV-GD-R--VTLT S-SW--LAS-GQ-L-AW KLDMALAC-GA--SGV YNSL--T--L-W---KLL-VTHF TF-GQ-AS-KLELK KLL--SSP-VTLN DLQMTQS-KDY D--L-S---RLL-NEMR TSD-VVVQEF KTASL-A---SFL DNT-A-LLYCGLA FL-PPSKDEQL D--L-S---RLL-NERM DSL-H--TGG-TS-R---Y GR---FSYS--YSFA-H QVTVQDKSA QASS-GS-P--RTLA LDS-LDSLLAEV-K WDKLLSC-Q--SGV-SS-C---M S-AGL-N-LQ--PAW NN-T-ALYCLLA PSAPSASD-DF SG-SQL-A-SW--LAW DN---NL--T--L------LL NN-T-ALLCYLA QVSLQDSKAF DD---DL--T--L-----TLL L-SNTNEYMKY PSVNRLL-A-PSVF DN-DL---TL--T--L-S---LL TKTGL-A---SFL VTTGW-GL-R--YT LS-Q--SGV-PR-S---F QASS-GS-P--ATLR GQ-GT-KLELKR S-T---ASGL--GSTA LLTDNAY-CGL-A LVDQLT---EFAK FSS-S--SGY-PT-R---M T--L-S---TLL-PEDF T--L-S---TLN-PEDF SPW-SLLNENW ARL-A-TLVNMG LAW-YQ-Q-KPE---K SL-Q--SGV-PR-S---F L-SNTDEYMKY SSTL-S--SNV-AS-K DN---DL--T--L-----TLL DN---DL--T--L-SL--TLL GSASV-GD-R--VTL LSTAASFL-K--A QVSL-Q--DK-AS-G---F TLL-DLDQAMR L-S---GLL-YEETR LAW-YQ-Q-KP---SGL STS-T--PGV-FS-R VT-AV--LNW-VQ-Q KKSLNSFSQTV SASV-GD-R--VTL QSASQ-PD-R--QLQ GT-KL--KGEM YCQQYNLYP-Y NNDL---TL--Y--N-S---LTL LVNQLT---EFAK SL-Q--SGV-PS-R---F TF-GQ-GT-GKGL L-A--SGL-GS-T---AS QVSLEDSKAF T--L-S---SLQ-PEDF T--L-V---T---PEVF TLLGVVT-QG V-GD-W--VQQTL SS--GSGE-RE---PL ASSS-T--PGV-Y SLLYAASSL TSPS--GHVV-DF LGLMSA-Q--SGV-PS-R L-Q---GV-VT-H---F TL-L--EGE-ES-R LSLSTSG-YQ-R LASYL-D--SLV-R GQ-GT-KLELK TF-GQ-GT-KLG SGLA---A-PSVF GPSSF-Q--GQV-PS KGLSTAASF PSSF-Q--GQV-PS ALSYLDSLLR VFP-FAPEVF PATLLRPAT QVSL-D--SGP-PS-M GKLLSTAASF KASL-T-ASFS SAL-NN---DL--T--L TLVGLVS---MA QCQYNLYP-Y NSLT-LN---SL--T--L GSTASVASTA WTLL-QEQSAK FYPE---LF GAESSYP-SLL TLVGLVT---QG GSLLYAASSL ASD-VVAGEEF NG-AWTLVGLV NNDL---TL--T--L-S---LL KLLTSAASF TLVGLVS---GM D-RN-VTLTLLK AC-GAG-SL-VS--L VVSG-VHCGVTT SRTSS-FSCLSR TLVGLVS---MS LCAASLV-S--S LSTAASFL-K TLVGLVS---AM VVSAAH-GD-R--DC DN-R--VTLTLLK ATGT-GT-RLEGM EP---ATGTKQM TLVGLVS---WK SSP-VTSGKF TLVGLVS---QA TL-VGL-V-SW--LK LS---DTDPGHM NEDWHLNENW VKLTTAAS-F DD---NL--T--L-----TL DYFPEAFTV KASL-K-PATL AS-Q-L-D-HW--L GKGLSTAASF R---GTGSRLGTGT SL-Q--SGV-PS-R NNT-A-LLYCLA QASS-GS-P--ATL SLLAYASSL SL-Q--DK-GT-F QASSGSPSV-VR KPEAPAK-APKSL GSTASGLSTA TLVGLVS---SM SL-Q--SGV-PR-S VSL-Q--DK-GT-F TSD-VKYGEF DN---DL--T--L-----TL SLSASV-GD-R LNTVQLAVA TF-GQ-GT-KL VVTQVTVQDK LSPATSL-N KLSTAASFL TLVGVLS---W AWA-A-PSVF TF-QG-GT-KL TLVGLVS---W AADK-A-KLVF AST-A-ASKF AS-QGL-S-SW Q--SR--PS-R---F KATL-P-AQF KAG-WGL-S-SW L--T--L-D---DNL-L FPLSATASF VVTATN-PD-R TL-VGL-V-SW--L HFDS---TLL-NENW WQTLVGLVS---W NTL--DD-L-N---TLL NVELDPELQK AASRPS-LL DLTASQ-PD-R Q--SGV-PS-R---F DN--D--L-L---TLL KATSL-A--SFL NNDL--T--L-SL--TLL VVSAA--GSGS-D TLV-GD-G--HTL NNDL--T--L-L---TLL SLTL--T--L-DN--DLL TL--DNNL-L---TLL DN---DL--T--L-M---L KVSP-PKPGVY ND-DL---TL--T--L-L QLDSLV-GE-R NNDL--T--L-----TLL TF-NA-GT-KL SKEAAESLYQ--SK KTEAAESLYQ--SK FYT-LLELKVE RASL-A-PSVF RNDV---TL--T--L-L---K VVTASQ-PD-R TV--T--L-SYDLTLL K-A-TLKGLM NRDV---TL--T--L-L---K AHSL-Q--DK LVTL--T--P-V---TLN YVTRE--GYTM SLSLSV-AR NNDL--T--L-S---LTL GMTQL-QQTL SAL-VGL-V-SW AMTQV-QQTL VSLSTAASF TF-GQ-SA-KL ASLRA-PSVF GLTANT-PD-R QVTVQDK KT-TGL-A-SF--L TF-AG-NT-KL KL-S-TA--LAS-F GTF-NA-GT-KL Q--DK-PS-R---F L--T--L-EL--TLL LATV-TP-R--V QYLSRP-M DL---TK--T--L-N LKASTL-A--SF TG-MW-GT-K VTWK--GSF VDK-A-KLVF SGV-QW---TL SGV-PS-R---F GT-KLHTL SL-AAPSVF EL--T--L-L---TLL LASL-R-PSL LALLCLLT---K L--N--L-K---GLL ELQQTQR SS-QGL-Q-SW LEAAWTL SL--T--L-SYDLTLL W--LGW-LQ-W L--T--L-ML--TLL NTAYCGLAS ELQLTQR GLVTLVS---D NNDL--T--L-L---TL L-PQDHAN SCQLSCK GLATV-TP-R--V ANNTLLY SLLYLAW AEF-VE-VT-KL NSL--T--L-EHDPTLL TKL-PAVF GGL--Y--L-E---QLL PKASL-L-Y DDGLFRN VCLPSASDDF GSDSSYL-TLL KLASTL-A--SF FSLL-SLR LL-APPER EM--LAR-Y QFSSSYL-SR PA-TLRVL VTLNMR KQWGL-S-SW QVSL-Q--DK WQPE---K-APK FYAAPEL NNDL---TL--T--L LASQ-PD-R GYLAASSL VTLTCR DLENKLQ LSSR-Q--SF QVSL-Q--KD KGAWGL-S-SW KL-A-GKVF FPP---K-GPK MELRYA KYGE-GT-K MK-W-TLV FPFVA-PEVF NNDL---TL--T

Combined_015

Type	Read
Score	37
Start on Template	9
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_018

Type	Read
Score	144
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_006

Type	Read
Score	128
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_039

Type	Read
Score	36
Start on Template	176
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C369

Type	Read
Score	128
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_077

Type	Read
Score	40
Start on Template	48
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_035

Type	Read
Score	116
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C191

Type	Read
Score	57
Start on Template	45
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1445

Type	Read
Score	50
Start on Template	166
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C434

Type	Read
Score	110
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1074_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	72
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_103

Type	Read
Score	158
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C530

Type	Read
Score	49
Start on Template	134
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C545

Type	Read
Score	115
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C63_004

Type	Read
Score	32
Start on Template	47
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C155_002

Type	Read
Score	132
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1388

Type	Read
Score	110
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C188_004

Type	Read
Score	67
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_920

Type	Read
Score	168
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C190_002

Type	Read
Score	124
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C558_002

Type	Read
Score	49
Start on Template	133
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C190_003

Type	Read
Score	116
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C424

Type	Read
Score	118
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_092

Type	Read
Score	124
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1411

Type	Read
Score	134
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C429

Type	Read
Score	128
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_880

Type	Read
Score	48
Start on Template	18
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C45_002

Type	Read
Score	73
Start on Template	33
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C182

Type	Read
Score	121
Start on Template	1
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C447_002

Type	Read
Score	150
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C574_002

Type	Read
Score	111
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1497

Type	Read
Score	100
Start on Template	25
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C135_003

Type	Read
Score	29
Start on Template	99
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1712

Type	Read
Score	40
Start on Template	128
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_111

Type	Read
Score	37
Start on Template	143
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_133

Type	Read
Score	104
Start on Template	49
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_138

Type	Read
Score	88
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_144

Type	Read
Score	34
Start on Template	109
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_319

Type	Read
Score	39
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_291

Type	Read
Score	52
Start on Template	69
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_167

Type	Read
Score	54
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1615

Type	Read
Score	49
Start on Template	91
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C90_005

Type	Read
Score	35
Start on Template	26
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_353

Type	Read
Score	52
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C380_002

Type	Read
Score	32
Start on Template	109
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_157

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C958

Type	Read
Score	40
Start on Template	143
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_498

Type	Read
Score	35
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_235

Type	Read
Score	37
Start on Template	132
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_242

Type	Read
Score	35
Start on Template	177
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_470

Type	Read
Score	37
Start on Template	132
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_269

Type	Read
Score	29
Start on Template	109
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1149

Type	Read
Score	31
Start on Template	50
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_311

Type	Read
Score	36
Start on Template	46
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1041

Type	Read
Score	55
Start on Template	160
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1919

Type	Read
Score	40
Start on Template	148
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_308

Type	Read
Score	64
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_768

Type	Read
Score	36
Start on Template	26
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_309

Type	Read
Score	92
Start on Template	49
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_526

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_313

Type	Read
Score	120
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1014

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_433

Type	Read
Score	39
Start on Template	55
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_401

Type	Read
Score	41
Start on Template	65
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C408_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	63
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C460_004

Type	Read
Score	35
Start on Template	1
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C635_002

Type	Read
Score	47
Start on Template	104
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_488

Type	Read
Score	35
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1064_004

Type	Read
Score	60
Start on Template	159
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1680

Type	Read
Score	56
Start on Template	49
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	31
Positional Score
Alignment graphic

C95_002

Type	Read
Score	34
Start on Template	11
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C104_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	26
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_447

Type	Read
Score	30
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_413

Type	Read
Score	68
Start on Template	49
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1657

Type	Read
Score	53
Start on Template	0
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C961_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	174
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C540

Type	Read
Score	52
Start on Template	54
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C928_003

Type	Read
Score	124
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1856_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	15
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_506

Type	Read
Score	34
Start on Template	143
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C297_003

Type	Read
Score	34
Start on Template	187
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1098

Type	Read
Score	32
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1061

Type	Read
Score	35
Start on Template	122
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1943_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	128
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1651

Type	Read
Score	37
Start on Template	99
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C300_005

Type	Read
Score	79
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C360_002

Type	Read
Score	36
Start on Template	18
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_538

Type	Read
Score	45
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_896

Type	Read
Score	76
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C320_004

Type	Read
Score	68
Start on Template	49
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1629_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	62
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2053

Type	Read
Score	25
Start on Template	45
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

Combined_579

Type	Read
Score	28
Start on Template	52
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C70_008

Type	Read
Score	44
Start on Template	55
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C113_003

Type	Read
Score	37
Start on Template	41
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_609

Type	Read
Score	34
Start on Template	180
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C543_002

Type	Read
Score	51
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C744_002

Type	Read
Score	43
Start on Template	47
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2119

Type	Read
Score	40
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C280_006

Type	Read
Score	42
Start on Template	56
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C333_002

Type	Read
Score	43
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_960

Type	Read
Score	35
Start on Template	16
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_827

Type	Read
Score	52
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_682

Type	Read
Score	48
Start on Template	53
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_832

Type	Read
Score	51
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1211_002

Type	Read
Score	35
Start on Template	76
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_703

Type	Read
Score	33
Start on Template	134
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1414_004

Type	Read
Score	67
Start on Template	46
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2769

Type	Read
Score	34
Start on Template	75
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_922

Type	Read
Score	41
Start on Template	65
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1794_003

Type	Read
Score	67
Start on Template	56
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_736

Type	Read
Score	35
Start on Template	25
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2767

Type	Read
Score	51
Start on Template	129
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2121

Type	Read
Score	36
Start on Template	25
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2948

Type	Read
Score	40
Start on Template	47
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_944

Type	Read
Score	30
Start on Template	10
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_892

Type	Read
Score	34
Start on Template	41
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1007_003

Type	Read
Score	37
Start on Template	169
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_998

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1697_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	134
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2526

Type	Read
Score	38
Start on Template	128
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_879

Type	Read
Score	34
Start on Template	11
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C100_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_816

Type	Read
Score	104
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_818

Type	Read
Score	69
Start on Template	95
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_820

Type	Read
Score	92
Start on Template	32
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C502_005

Type	Read
Score	45
Start on Template	16
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C504_002

Type	Read
Score	33
Start on Template	16
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C604_003

Type	Read
Score	35
Start on Template	46
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C632_004

Type	Read
Score	35
Start on Template	50
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C779_003

Type	Read
Score	51
Start on Template	45
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1050

Type	Read
Score	132
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1051_003

Type	Read
Score	107
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2218

Type	Read
Score	42
Start on Template	1
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1819_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	90
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_877

Type	Read
Score	35
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_943

Type	Read
Score	36
Start on Template	137
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C26_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	203
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C70_009

Type	Read
Score	37
Start on Template	50
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C119_004

Type	Read
Score	33
Start on Template	195
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1084

Type	Read
Score	35
Start on Template	69
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2210

Type	Read
Score	50
Start on Template	154
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C629_002

Type	Read
Score	37
Start on Template	46
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C790_004

Type	Read
Score	31
Start on Template	50
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2691

Type	Read
Score	49
Start on Template	46
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1539

Type	Read
Score	30
Start on Template	153
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1058

Type	Read
Score	49
Start on Template	134
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1164

Type	Read
Score	29
Start on Template	196
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1006

Type	Read
Score	37
Start on Template	66
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1166

Type	Read
Score	51
Start on Template	56
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C2083_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	48
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2427_002

Type	Read
Score	86
Start on Template	71
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C3026

Type	Read
Score	39
Start on Template	147
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2532

Type	Read
Score	35
Start on Template	10
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_948

Type	Read
Score	84
Start on Template	33
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_950

Type	Read
Score	84
Start on Template	49
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_952

Type	Read
Score	38
Start on Template	26
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C359_004

Type	Read
Score	38
Start on Template	8
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_955

Type	Read
Score	87
Start on Template	95
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_957

Type	Read
Score	56
Start on Template	55
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1139

Type	Read
Score	69
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_959

Type	Read
Score	88
Start on Template	95
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C621_004

Type	Read
Score	35
Start on Template	69
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_962

Type	Read
Score	112
Start on Template	47
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C652_004

Type	Read
Score	42
Start on Template	14
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_968

Type	Read
Score	63
Start on Template	110
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3571

Type	Read
Score	40
Start on Template	5
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_982

Type	Read
Score	44
Start on Template	111
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_985

Type	Read
Score	29
Start on Template	177
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1241_002

Type	Read
Score	102
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1356_002

Type	Read
Score	64
Start on Template	46
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_995

Type	Read
Score	62
Start on Template	86
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2126_002

Type	Read
Score	77
Start on Template	110
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2181

Type	Read
Score	46
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2185

Type	Read
Score	106
Start on Template	111
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1012

Type	Read
Score	97
Start on Template	111
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1025

Type	Read
Score	102
Start on Template	71
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1034

Type	Read
Score	52
Start on Template	25
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1077

Type	Read
Score	86
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C351_004

Type	Read
Score	41
Start on Template	8
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C363_003

Type	Read
Score	36
Start on Template	109
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1080

Type	Read
Score	71
Start on Template	97
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C427_003

Type	Read
Score	78
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C460_006

Type	Read
Score	43
Start on Template	42
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1638

Type	Read
Score	86
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C648_003

Type	Read
Score	134
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2090

Type	Read
Score	53
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1210_002

Type	Read
Score	35
Start on Template	43
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2051

Type	Read
Score	46
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C2116_003

Type	Read
Score	34
Start on Template	12
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1136

Type	Read
Score	96
Start on Template	33
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2085

Type	Read
Score	40
Start on Template	71
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2483

Type	Read
Score	86
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1079

Type	Read
Score	104
Start on Template	32
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C333_003

Type	Read
Score	43
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3257

Type	Read
Score	54
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2849

Type	Read
Score	58
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1083

Type	Read
Score	80
Start on Template	11
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C484_004

Type	Read
Score	100
Start on Template	47
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C567_002

Type	Read
Score	92
Start on Template	46
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C621_005

Type	Read
Score	53
Start on Template	191
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1606

Type	Read
Score	37
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2840

Type	Read
Score	120
Start on Template	71
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3338

Type	Read
Score	90
Start on Template	58
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1765_004

Type	Read
Score	68
Start on Template	59
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C177_008

Type	Read
Score	39
Start on Template	51
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1074

Type	Read
Score	96
Start on Template	49
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1654

Type	Read
Score	88
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C641_003

Type	Read
Score	39
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1612

Type	Read
Score	86
Start on Template	49
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1068_003

Type	Read
Score	40
Start on Template	65
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1153

Type	Read
Score	80
Start on Template	91
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1225_003

Type	Read
Score	93
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1638_003

Type	Read
Score	44
Start on Template	174
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1681_003

Type	Read
Score	48
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1763_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	52
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1855_007

Type	Read
Score	97
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1979_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	64
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2516

Type	Read
Score	46
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2151_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	87
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2465_003

Type	Read
Score	82
Start on Template	72
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C386_009

Type	Read
Score	35
Start on Template	154
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C532_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	46
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3537

Type	Read
Score	49
Start on Template	154
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C630_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	47
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2089

Type	Read
Score	41
Start on Template	156
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C741_004

Type	Read
Score	33
Start on Template	47
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1152_003

Type	Read
Score	84
Start on Template	48
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1325_003

Type	Read
Score	43
Start on Template	62
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3608

Type	Read
Score	47
Start on Template	126
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2456

Type	Read
Score	136
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2562

Type	Read
Score	109
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2105_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	68
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1627

Type	Read
Score	97
Start on Template	69
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C2791_002

Type	Read
Score	43
Start on Template	29
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1223

Type	Read
Score	33
Start on Template	0
Length on Template	7
Start on Read	2
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1225

Type	Read
Score	29
Start on Template	118
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1226

Type	Read
Score	39
Start on Template	52
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1227

Type	Read
Score	35
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C231_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	104
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1241

Type	Read
Score	35
Start on Template	9
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1331

Type	Read
Score	35
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1251

Type	Read
Score	38
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1252

Type	Read
Score	39
Start on Template	74
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1199

Type	Read
Score	39
Start on Template	202
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1263

Type	Read
Score	43
Start on Template	12
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C513_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	133
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C523_005

Type	Read
Score	60
Start on Template	52
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1270

Type	Read
Score	31
Start on Template	10
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1420

Type	Read
Score	52
Start on Template	47
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C808_005

Type	Read
Score	31
Start on Template	133
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1482

Type	Read
Score	110
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1357

Type	Read
Score	144
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1310_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	169
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1369_004

Type	Read
Score	45
Start on Template	23
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1301

Type	Read
Score	46
Start on Template	14
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1813_005

Type	Read
Score	51
Start on Template	25
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C1830_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1861_007

Type	Read
Score	53
Start on Template	72
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1319

Type	Read
Score	49
Start on Template	69
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1322

Type	Read
Score	35
Start on Template	49
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C306_008

Type	Read
Score	33
Start on Template	175
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C702_008

Type	Read
Score	45
Start on Template	133
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1120_004

Type	Read
Score	90
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1708_006

Type	Read
Score	49
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1731_004

Type	Read
Score	55
Start on Template	72
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C62_012

Type	Read
Score	35
Start on Template	49
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1417

Type	Read
Score	34
Start on Template	76
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1448

Type	Read
Score	48
Start on Template	47
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C873_004

Type	Read
Score	150
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1099_006

Type	Read
Score	127
Start on Template	25
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1439_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	6
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1703_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1713_006

Type	Read
Score	53
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1768_004

Type	Read
Score	58
Start on Template	69
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C644_003

Type	Read
Score	134
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C85_007

Type	Read
Score	112
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	2
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C417_006

Type	Read
Score	121
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1014_006

Type	Read
Score	39
Start on Template	100
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1478

Type	Read
Score	118
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C589_006

Type	Read
Score	148
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C784_005

Type	Read
Score	90
Start on Template	26
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1447

Type	Read
Score	85
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C334_010

Type	Read
Score	35
Start on Template	76
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2742

Type	Read
Score	90
Start on Template	46
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1496

Type	Read
Score	40
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1459

Type	Read
Score	40
Start on Template	72
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C19_007

Type	Read
Score	30
Start on Template	18
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C322_008

Type	Read
Score	117
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C674_006

Type	Read
Score	126
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C792_011

Type	Read
Score	40
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C900_004

Type	Read
Score	101
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C916_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	67
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C363_006

Type	Read
Score	96
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1500

Type	Read
Score	37
Start on Template	42
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1491

Type	Read
Score	34
Start on Template	133
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C829_005

Type	Read
Score	113
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C575_008

Type	Read
Score	118
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C587_004

Type	Read
Score	83
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C851_003

Type	Read
Score	101
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1021_004

Type	Read
Score	107
Start on Template	110
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C190_012

Type	Read
Score	32
Start on Template	129
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C624_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	26
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1569

Type	Read
Score	43
Start on Template	132
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1575

Type	Read
Score	41
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C60_007

Type	Read
Score	36
Start on Template	99
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1683

Type	Read
Score	42
Start on Template	168
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C373_007

Type	Read
Score	49
Start on Template	88
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1351_005

Type	Read
Score	49
Start on Template	10
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1722

Type	Read
Score	52
Start on Template	68
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C148_007

Type	Read
Score	41
Start on Template	44
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1697

Type	Read
Score	41
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C209_009

Type	Read
Score	46
Start on Template	44
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C234_011

Type	Read
Score	45
Start on Template	42
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C63_015

Type	Read
Score	58
Start on Template	38
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C223_008

Type	Read
Score	69
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C404_009

Type	Read
Score	47
Start on Template	154
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C512_007

Type	Read
Score	31
Start on Template	109
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2853

Type	Read
Score	98
Start on Template	71
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1701_007

Type	Read
Score	71
Start on Template	67
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C904_005

Type	Read
Score	36
Start on Template	51
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1927_004

Type	Read
Score	53
Start on Template	112
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C31_013

Type	Read
Score	74
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2875

Type	Read
Score	61
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2493

Type	Read
Score	47
Start on Template	154
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1245_007

Type	Read
Score	52
Start on Template	179
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2463

Type	Read
Score	102
Start on Template	72
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1490_006

Type	Read
Score	44
Start on Template	197
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1732

Type	Read
Score	34
Start on Template	12
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1767

Type	Read
Score	29
Start on Template	102
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1867

Type	Read
Score	39
Start on Template	180
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C792_012

Type	Read
Score	48
Start on Template	19
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1973

Type	Read
Score	31
Start on Template	143
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1836

Type	Read
Score	35
Start on Template	25
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1838

Type	Read
Score	39
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2017_004

Type	Read
Score	45
Start on Template	73
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1750

Type	Read
Score	44
Start on Template	73
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C310_010

Type	Read
Score	51
Start on Template	56
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C362_006

Type	Read
Score	37
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C394_007

Type	Read
Score	48
Start on Template	180
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1967

Type	Read
Score	34
Start on Template	129
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C853_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C926_007

Type	Read
Score	61
Start on Template	10
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1893

Type	Read
Score	45
Start on Template	6
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1896

Type	Read
Score	39
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C251_018

Type	Read
Score	29
Start on Template	69
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2057

Type	Read
Score	34
Start on Template	60
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2094

Type	Read
Score	39
Start on Template	45
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2166

Type	Read
Score	39
Start on Template	73
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1944

Type	Read
Score	34
Start on Template	20
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C886_005

Type	Read
Score	41
Start on Template	6
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1507

Type	Read
Score	42
Start on Template	64
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C736_009

Type	Read
Score	58
Start on Template	0
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1149_005

Type	Read
Score	96
Start on Template	0
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C891_007

Type	Read
Score	45
Start on Template	59
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1121_011

Type	Read
Score	158
Start on Template	0
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C324_010

Type	Read
Score	31
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C432_008

Type	Read
Score	40
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C509_009

Type	Read
Score	43
Start on Template	47
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C768_008

Type	Read
Score	43
Start on Template	44
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C897_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1436_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	47
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2343

Type	Read
Score	32
Start on Template	69
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2166

Type	Read
Score	35
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2346

Type	Read
Score	49
Start on Template	134
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2353

Type	Read
Score	51
Start on Template	37
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C2413_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	178
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2530

Type	Read
Score	33
Start on Template	129
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2307

Type	Read
Score	32
Start on Template	12
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2209

Type	Read
Score	35
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C494_008

Type	Read
Score	36
Start on Template	44
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2441

Type	Read
Score	50
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C659_006

Type	Read
Score	43
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2175

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2276

Type	Read
Score	48
Start on Template	128
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1500_010

Type	Read
Score	49
Start on Template	133
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1516_006

Type	Read
Score	40
Start on Template	10
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1604_006

Type	Read
Score	40
Start on Template	10
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2406

Type	Read
Score	41
Start on Template	21
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2295

Type	Read
Score	37
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2570

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2356

Type	Read
Score	40
Start on Template	10
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2407_003

Type	Read
Score	55
Start on Template	129
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C2421

Type	Read
Score	39
Start on Template	156
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2499

Type	Read
Score	53
Start on Template	129
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C129_012

Type	Read
Score	36
Start on Template	47
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2588

Type	Read
Score	29
Start on Template	69
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C522_013

Type	Read
Score	40
Start on Template	46
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2259

Type	Read
Score	36
Start on Template	46
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C684_009

Type	Read
Score	51
Start on Template	54
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C726_009

Type	Read
Score	29
Start on Template	66
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1424_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	133
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3182

Type	Read
Score	48
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2447_002

Type	Read
Score	56
Start on Template	128
Length on Template	32
Start on Read	0
Length of Read	28
Positional Score
Alignment graphic

C2596

Type	Read
Score	40
Start on Template	128
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2322

Type	Read
Score	43
Start on Template	150
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3402

Type	Read
Score	33
Start on Template	0
Length on Template	7
Start on Read	2
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C996_009

Type	Read
Score	60
Start on Template	128
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1430_010

Type	Read
Score	34
Start on Template	28
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1542_009

Type	Read
Score	48
Start on Template	133
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2391

Type	Read
Score	40
Start on Template	10
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1555_006

Type	Read
Score	60
Start on Template	50
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2390

Type	Read
Score	40
Start on Template	90
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2623

Type	Read
Score	31
Start on Template	7
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3708

Type	Read
Score	40
Start on Template	72
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C32_019

Type	Read
Score	35
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C226_012

Type	Read
Score	74
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1147_005

Type	Read
Score	63
Start on Template	46
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2451

Type	Read
Score	33
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1464_005

Type	Read
Score	58
Start on Template	131
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2819_003

Type	Read
Score	53
Start on Template	129
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C77_012

Type	Read
Score	95
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3681

Type	Read
Score	78
Start on Template	95
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C275_016

Type	Read
Score	45
Start on Template	47
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C457_012

Type	Read
Score	51
Start on Template	188
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C931_010

Type	Read
Score	62
Start on Template	47
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C1361_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	126
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1384_008

Type	Read
Score	46
Start on Template	10
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1397_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1449_009

Type	Read
Score	50
Start on Template	128
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1518_007

Type	Read
Score	48
Start on Template	133
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2409

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2299_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	10
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2480_006

Type	Read
Score	42
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C116_018

Type	Read
Score	41
Start on Template	96
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C321_016

Type	Read
Score	86
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C478_011

Type	Read
Score	142
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2597

Type	Read
Score	40
Start on Template	47
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1158_008

Type	Read
Score	44
Start on Template	133
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1569_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	14
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2707

Type	Read
Score	35
Start on Template	7
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2172_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	156
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2572

Type	Read
Score	55
Start on Template	54
Length on Template	31
Start on Read	0
Length of Read	28
Positional Score
Alignment graphic

C2619_002

Type	Read
Score	76
Start on Template	24
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2527

Type	Read
Score	35
Start on Template	132
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C191_017

Type	Read
Score	33
Start on Template	97
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C252_020

Type	Read
Score	83
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C769_009

Type	Read
Score	51
Start on Template	51
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2827

Type	Read
Score	37
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1657_009

Type	Read
Score	108
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2706

Type	Read
Score	40
Start on Template	90
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1893_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	64
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1965_006

Type	Read
Score	76
Start on Template	25
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2640

Type	Read
Score	29
Start on Template	51
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2643

Type	Read
Score	135
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3103

Type	Read
Score	34
Start on Template	150
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C651_012

Type	Read
Score	45
Start on Template	42
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1154_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	174
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1890_009

Type	Read
Score	49
Start on Template	51
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C2709_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2802_004

Type	Read
Score	56
Start on Template	129
Length on Template	31
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C114_019

Type	Read
Score	40
Start on Template	10
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3342

Type	Read
Score	34
Start on Template	154
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C127_019

Type	Read
Score	35
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2641

Type	Read
Score	64
Start on Template	54
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C761_007

Type	Read
Score	33
Start on Template	24
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1051_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	169
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1683_006

Type	Read
Score	36
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1881_007

Type	Read
Score	39
Start on Template	55
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2977_003

Type	Read
Score	39
Start on Template	196
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3718

Type	Read
Score	134
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3190

Type	Read
Score	33
Start on Template	143
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C817_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	52
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C985_003

Type	Read
Score	31
Start on Template	50
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1386_006

Type	Read
Score	35
Start on Template	154
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1484_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	55
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1572_010

Type	Read
Score	40
Start on Template	71
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2674_006

Type	Read
Score	70
Start on Template	24
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C201_015

Type	Read
Score	35
Start on Template	62
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C459_008

Type	Read
Score	45
Start on Template	24
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C566_010

Type	Read
Score	45
Start on Template	153
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C584_013

Type	Read
Score	40
Start on Template	46
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1219_009

Type	Read
Score	46
Start on Template	48
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3521

Type	Read
Score	43
Start on Template	131
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1742_008

Type	Read
Score	106
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C2072_005

Type	Read
Score	115
Start on Template	25
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3710

Type	Read
Score	42
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C551_012

Type	Read
Score	97
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C720_020

Type	Read
Score	98
Start on Template	110
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2107_006

Type	Read
Score	39
Start on Template	15
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C527_013

Type	Read
Score	34
Start on Template	69
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1220_011

Type	Read
Score	36
Start on Template	13
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1826_008

Type	Read
Score	39
Start on Template	20
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C457_013

Type	Read
Score	49
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C606_007

Type	Read
Score	38
Start on Template	69
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C411_016

Type	Read
Score	44
Start on Template	6
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C919_010

Type	Read
Score	42
Start on Template	8
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C666_008

Type	Read
Score	102
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C861_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	21
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1640_007

Type	Read
Score	54
Start on Template	72
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1927_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	170
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2106_005

Type	Read
Score	40
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C685_015

Type	Read
Score	102
Start on Template	47
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C789_010

Type	Read
Score	45
Start on Template	71
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C709_013

Type	Read
Score	45
Start on Template	73
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C473_010

Type	Read
Score	61
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1829_013

Type	Read
Score	36
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C786_011

Type	Read
Score	31
Start on Template	153
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C829_010

Type	Read
Score	42
Start on Template	151
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1769_008

Type	Read
Score	94
Start on Template	71
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2118_007

Type	Read
Score	44
Start on Template	53
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C278_014

Type	Read
Score	69
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C526_014

Type	Read
Score	49
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C695_011

Type	Read
Score	33
Start on Template	10
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1138_010

Type	Read
Score	43
Start on Template	163
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1684_009

Type	Read
Score	60
Start on Template	67
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C396_011

Type	Read
Score	33
Start on Template	42
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C755_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	196
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C71_017

Type	Read
Score	34
Start on Template	8
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3049

Type	Read
Score	35
Start on Template	200
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3001

Type	Read
Score	32
Start on Template	19
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2953

Type	Read
Score	35
Start on Template	12
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C839_013

Type	Read
Score	42
Start on Template	144
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2965

Type	Read
Score	32
Start on Template	129
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C123_016

Type	Read
Score	35
Start on Template	200
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C241_020

Type	Read
Score	37
Start on Template	40
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3071

Type	Read
Score	37
Start on Template	59
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3476

Type	Read
Score	39
Start on Template	8
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C968_016

Type	Read
Score	41
Start on Template	129
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C215_013

Type	Read
Score	25
Start on Template	30
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C416_019

Type	Read
Score	29
Start on Template	123
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C931_011

Type	Read
Score	44
Start on Template	19
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3088

Type	Read
Score	35
Start on Template	129
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C680_014

Type	Read
Score	29
Start on Template	131
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1657_014

Type	Read
Score	29
Start on Template	89
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C381_023

Type	Read
Score	40
Start on Template	60
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1008_011

Type	Read
Score	39
Start on Template	9
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C47_018

Type	Read
Score	34
Start on Template	12
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C104_025

Type	Read
Score	35
Start on Template	59
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C562_017

Type	Read
Score	30
Start on Template	130
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C441_015

Type	Read
Score	35
Start on Template	44
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C730_011

Type	Read
Score	41
Start on Template	154
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3214

Type	Read
Score	31
Start on Template	12
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C749_018

Type	Read
Score	36
Start on Template	109
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C909_012

Type	Read
Score	29
Start on Template	78
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3314

Type	Read
Score	42
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3112

Type	Read
Score	29
Start on Template	76
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1046_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	133
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1101_009

Type	Read
Score	35
Start on Template	128
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1173_008

Type	Read
Score	34
Start on Template	51
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1620_010

Type	Read
Score	31
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2399_003

Type	Read
Score	34
Start on Template	42
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3202

Type	Read
Score	25
Start on Template	119
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C2918_005

Type	Read
Score	35
Start on Template	66
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3128

Type	Read
Score	36
Start on Template	116
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C466_015

Type	Read
Score	36
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C577_016

Type	Read
Score	28
Start on Template	52
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3192

Type	Read
Score	31
Start on Template	96
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1761_008

Type	Read
Score	35
Start on Template	62
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1924_012

Type	Read
Score	35
Start on Template	64
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3146

Type	Read
Score	36
Start on Template	14
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3222

Type	Read
Score	31
Start on Template	19
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3157

Type	Read
Score	36
Start on Template	24
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3304

Type	Read
Score	31
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3274

Type	Read
Score	31
Start on Template	113
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1083_011

Type	Read
Score	29
Start on Template	53
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1432_011

Type	Read
Score	31
Start on Template	25
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2291_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	176
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C715_012

Type	Read
Score	46
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1595_006

Type	Read
Score	31
Start on Template	66
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2544_006

Type	Read
Score	45
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C3020_002

Type	Read
Score	33
Start on Template	48
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C3716

Type	Read
Score	54
Start on Template	55
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C3727

Type	Read
Score	43
Start on Template	10
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C18_010

Type	Read
Score	29
Start on Template	12
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C670_015

Type	Read
Score	54
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1310_012

Type	Read
Score	35
Start on Template	44
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2244_007

Type	Read
Score	31
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3244

Type	Read
Score	40
Start on Template	73
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C488_012

Type	Read
Score	86
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C528_011

Type	Read
Score	86
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C776_008

Type	Read
Score	76
Start on Template	95
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3352

Type	Read
Score	44
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3284

Type	Read
Score	36
Start on Template	44
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1071_013

Type	Read
Score	80
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1105_012

Type	Read
Score	46
Start on Template	54
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1126_010

Type	Read
Score	52
Start on Template	110
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3264

Type	Read
Score	37
Start on Template	109
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2112_007

Type	Read
Score	37
Start on Template	143
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3325

Type	Read
Score	62
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C3407

Type	Read
Score	33
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C3447

Type	Read
Score	94
Start on Template	72
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3279

Type	Read
Score	29
Start on Template	112
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3280

Type	Read
Score	83
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3281

Type	Read
Score	68
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C794_018

Type	Read
Score	63
Start on Template	95
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3288

Type	Read
Score	37
Start on Template	26
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1008_012

Type	Read
Score	36
Start on Template	45
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1122_008

Type	Read
Score	68
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1144_008

Type	Read
Score	36
Start on Template	143
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1491_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	180
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2086_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	110
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C2239_005

Type	Read
Score	71
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2362_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	9
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2761_007

Type	Read
Score	34
Start on Template	9
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C191_024

Type	Read
Score	31
Start on Template	10
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C783_013

Type	Read
Score	53
Start on Template	95
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1034_015

Type	Read
Score	43
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1143_010

Type	Read
Score	29
Start on Template	72
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1228_006

Type	Read
Score	56
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1408_008

Type	Read
Score	34
Start on Template	195
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3316

Type	Read
Score	46
Start on Template	25
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1561_009

Type	Read
Score	31
Start on Template	28
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2397_004

Type	Read
Score	80
Start on Template	73
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2831_003

Type	Read
Score	32
Start on Template	72
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C3731

Type	Read
Score	37
Start on Template	68
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3341

Type	Read
Score	29
Start on Template	39
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C515_017

Type	Read
Score	36
Start on Template	153
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C659_013

Type	Read
Score	42
Start on Template	45
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C668_011

Type	Read
Score	71
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C678_018

Type	Read
Score	79
Start on Template	96
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C710_011

Type	Read
Score	74
Start on Template	95
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C785_013

Type	Read
Score	88
Start on Template	60
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C932_009

Type	Read
Score	39
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3353

Type	Read
Score	80
Start on Template	32
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1005_018

Type	Read
Score	72
Start on Template	97
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1017_013

Type	Read
Score	79
Start on Template	11
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3354

Type	Read
Score	67
Start on Template	95
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1050_012

Type	Read
Score	43
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1139_013

Type	Read
Score	42
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1344_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	51
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3381

Type	Read
Score	35
Start on Template	54
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1392_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	48
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1423_007

Type	Read
Score	84
Start on Template	49
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3382

Type	Read
Score	64
Start on Template	24
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1717_016

Type	Read
Score	69
Start on Template	9
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1729_007

Type	Read
Score	55
Start on Template	9
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1893_014

Type	Read
Score	81
Start on Template	91
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1908_009

Type	Read
Score	42
Start on Template	108
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3362

Type	Read
Score	98
Start on Template	91
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1917_011

Type	Read
Score	88
Start on Template	91
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1928_009

Type	Read
Score	59
Start on Template	91
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C2448_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	110
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C2557_006

Type	Read
Score	56
Start on Template	91
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2572_006

Type	Read
Score	75
Start on Template	91
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2652_004

Type	Read
Score	72
Start on Template	45
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2812_006

Type	Read
Score	74
Start on Template	44
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2854_007

Type	Read
Score	116
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2905_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	139
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2958_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	52
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C3027_003

Type	Read
Score	95
Start on Template	71
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C3077_002

Type	Read
Score	34
Start on Template	24
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C3469_002

Type	Read
Score	51
Start on Template	79
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3387

Type	Read
Score	38
Start on Template	45
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C3531

Type	Read
Score	66
Start on Template	64
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3388

Type	Read
Score	29
Start on Template	31
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C560_015

Type	Read
Score	72
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C820_018

Type	Read
Score	41
Start on Template	39
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1247_010

Type	Read
Score	38
Start on Template	108
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1444_013

Type	Read
Score	37
Start on Template	102
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1858_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	180
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2459_004

Type	Read
Score	60
Start on Template	45
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2823_006

Type	Read
Score	78
Start on Template	71
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C3119

Type	Read
Score	66
Start on Template	59
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C307_019

Type	Read
Score	72
Start on Template	9
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C311_020

Type	Read
Score	60
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C716_017

Type	Read
Score	53
Start on Template	95
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2026_012

Type	Read
Score	71
Start on Template	45
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2268_004

Type	Read
Score	124
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C116_025

Type	Read
Score	41
Start on Template	144
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C46_019

Type	Read
Score	43
Start on Template	144
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C41_018

Type	Read
Score	38
Start on Template	51
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3401

Type	Read
Score	28
Start on Template	193
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C222_022

Type	Read
Score	34
Start on Template	4
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C281_024

Type	Read
Score	37
Start on Template	176
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C498_018

Type	Read
Score	80
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C781_015

Type	Read
Score	118
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C950_011

Type	Read
Score	89
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1180_011

Type	Read
Score	50
Start on Template	72
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C766_011

Type	Read
Score	50
Start on Template	72
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C71_022

Type	Read
Score	38
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3426

Type	Read
Score	34
Start on Template	97
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C133_024

Type	Read
Score	31
Start on Template	161
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C40_025

Type	Read
Score	39
Start on Template	8
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C189_022

Type	Read
Score	34
Start on Template	109
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C203_025

Type	Read
Score	35
Start on Template	53
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3638

Type	Read
Score	36
Start on Template	153
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C513_014

Type	Read
Score	43
Start on Template	169
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C812_015

Type	Read
Score	45
Start on Template	1
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3553

Type	Read
Score	39
Start on Template	25
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1151_010

Type	Read
Score	63
Start on Template	56
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C355_021

Type	Read
Score	47
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C61_018

Type	Read
Score	29
Start on Template	95
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C315_027

Type	Read
Score	52
Start on Template	153
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C779_018

Type	Read
Score	50
Start on Template	128
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C198_028

Type	Read
Score	37
Start on Template	110
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1283_009

Type	Read
Score	55
Start on Template	57
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1338_008

Type	Read
Score	39
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C168_025

Type	Read
Score	33
Start on Template	143
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3648

Type	Read
Score	43
Start on Template	64
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1262_010

Type	Read
Score	126
Start on Template	45
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C356_020

Type	Read
Score	44
Start on Template	117
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1270_011

Type	Read
Score	53
Start on Template	56
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1588_011

Type	Read
Score	45
Start on Template	64
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C536_021

Type	Read
Score	38
Start on Template	106
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C562_020

Type	Read
Score	54
Start on Template	131
Length on Template	40
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C667_014

Type	Read
Score	118
Start on Template	45
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3700

Type	Read
Score	97
Start on Template	111
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2100_008

Type	Read
Score	41
Start on Template	69
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C358_016

Type	Read
Score	70
Start on Template	32
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C748_022

Type	Read
Score	67
Start on Template	91
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C757_019

Type	Read
Score	44
Start on Template	1
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1332_014

Type	Read
Score	120
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1377_015

Type	Read
Score	46
Start on Template	39
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1598_016

Type	Read
Score	105
Start on Template	25
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1627_019

Type	Read
Score	97
Start on Template	111
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1894_012

Type	Read
Score	84
Start on Template	72
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2096_013

Type	Read
Score	43
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C237_030

Type	Read
Score	49
Start on Template	55
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C392_019

Type	Read
Score	121
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C585_012

Type	Read
Score	39
Start on Template	202
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C628_011

Type	Read
Score	56
Start on Template	130
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3725

Type	Read
Score	52
Start on Template	47
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1027_013

Type	Read
Score	105
Start on Template	27
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1332_015

Type	Read
Score	111
Start on Template	24
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C399_023

Type	Read
Score	72
Start on Template	0
Length on Template	18
Start on Read	7
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C846_024

Type	Read
Score	46
Start on Template	131
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C872_015

Type	Read
Score	59
Start on Template	52
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1052_015

Type	Read
Score	39
Start on Template	46
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1064_020

Type	Read
Score	123
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1349_014

Type	Read
Score	102
Start on Template	25
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1473_016

Type	Read
Score	52
Start on Template	52
Length on Template	31
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1610_012

Type	Read
Score	126
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1637_007

Type	Read
Score	70
Start on Template	112
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

>REC-0-4_002 template
.DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDLTLTISTLLPEDFATYYEQQYNLYPTFGQGTKLEIKREPKASLAPSVFLFPPSDEQLKANKATLVGLVSDLPYQVSLNDKALTSPVVVAGEFDQGSKSSDDRPAASSYLSLTLEQQKSVVSFSVEVTHEGSWVEKTGAANERS
>C562_020 score:54 alignment:11M2D5M11D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.ALGHSGQ...DFW..AVVVA..............GEF...DQGSKESS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2447_002 score:56 alignment:1I19M6D3M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KAGD.W.TLVGLVS...WGSSGMST........STPGVRAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1473_016 score:52 alignment:3M1D4M3D9M3D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.V...GV.LS.......GE..GSST.CS...T........S...TPG.VRSF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2802_004 score:56 alignment:1S[1,2]17M6D3M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGE.W.TLVGLVS...WGSSGMST........STPGVRAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2572 score:55 alignment:1I6M1S[1,2]9M5D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KQ..WDT.LV.GL...VSGE..GSST.C.............S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1680 score:56 alignment:1I3M2S[2,2]23M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SATTVT...NTVD.PS.Q...DDFA..GTTS.DT...TG..W..G.L...TRY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1813_005 score:51 alignment:9M3D10M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LDL.D.SL..LA.....E.VKG...M.GDKDL..AQSSL.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2499 score:53 alignment:1I8M5D16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SNA.W.TLVGL........PGVMTLVGNAW..TPG.VY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1166 score:51 alignment:8M1S[2,2]3M6D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GV.LT.L...VSWG..SSGM...............S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1151_010 score:63 alignment:14M5D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GV.LT.L...VSGQ..GSST.C.............S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1794_003 score:67 alignment:14M5D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GV.LT.L...VSGE..GSST.C.............S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2767 score:51 alignment:3M1I6M4D16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NG.AWTLVGLV.......DGVGLVAGNAW..TPG.VY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1283_009 score:55 alignment:13M5D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~V.LT.L...LSGQ..GSST.C.............S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C628_011 score:56 alignment:10M3D10M2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~K.L.EVHCGVS...C...GAVVVAGEMDQGSSS.EK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3338 score:90 alignment:5M5D18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PE.D...FA.......T.YS...TL..T..P.E...DFA.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C624_004 score:51 alignment:7M6D11M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QLL.S.SR..D.........PE...Q.ASLPLLSGGTN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1765_004 score:68 alignment:1I13M4D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.D...FATY..PEPE.DF...A............TTY.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3119 score:66 alignment:1I8M2D3M4D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.D...FATS..PE...DF...A............TSQ.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1417 score:34 alignment:1I5M17D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WTLL.QE...................Q.GT.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2407_003 score:55 alignment:26M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NA.W.TLVGLLS...WGSSTCSTSTPGVR..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C411_016 score:44 alignment:8M10D8M unique:False
~~~~~~~~S.ASAPSAS..............AS.QPS.A.SN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C926_007 score:61 alignment:1I10M5D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~DLSNSV.TV.S..VT.....S.STL.S.SN..VAK.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2819_003 score:53 alignment:1S[1,2]25M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGE.W.TLVGLVS...WGSSGMSTSTPGVR..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1615 score:49 alignment:3M1D3M1D8M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..TL.G..GD.NLTLLG..KATL.T.SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C931_010 score:62 alignment:1I7M1S[1,2]17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDAMLSS.GA..SGV.SS.C...MGDS..GGPL.KA...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1147_005 score:63 alignment:8M1S[1,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLSS.GA..SGV.SS.G...GCGA..GYLL.HC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3716 score:54 alignment:1S[2,2]8M3D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSA.PS.A...PSGT.....D.DF...AA..T..T.T...TTG.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C757_019 score:44 alignment:3M1S[2,2]3M1D6M5D5M unique:False
~~~LQGQTL.PL.LSNTD.G........TDHAS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C789_010 score:45 alignment:2I5M1S[2,2]4M9D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.S...LTL.LKK.........NSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1270_011 score:53 alignment:6M1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GV.LT.L...VGSE..GSST.CS...TS..T..P.G...VYR.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1356_002 score:64 alignment:16M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLCA.Q..SGV.SS.C...M.GD..GSGP.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1436_004 score:51 alignment:1I7M1S[1,2]8M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDAMLSS.GA..SGV.EM.M...GDSG..GPLK.AM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2276 score:48 alignment:3M1I12M1S[2,1]1M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADGEA.VLVPGSS...MPSMQVSLQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C996_009 score:60 alignment:1I18M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADDE.A.VLVPGSS...MPSMGAVSLQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2691 score:49 alignment:23M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLCA.Q..SGV.SS.S...CSCL..KLHC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1943_002 score:46 alignment:9M3D7M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGV.Y.TLVGL......SWPGVYTLGVM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1449_009 score:50 alignment:1I15M1S[2,1]1M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADDE.A.VLVPGSS...MPSMQVSLQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1414_004 score:67 alignment:23M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGLMADML.Q..SGV.SS.C...MGNS..GGPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1819_003 score:38 alignment:3M9D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNS.............LTLKGLTYNSM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1858_006 score:47 alignment:4M4D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGTA....SVVSSTMEVTHQ..GL~~~~~~~~~~
>C404_009 score:47 alignment:4M1S[3,3]6M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SD.VVVAGEM...DQGS..STDKLGA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1420 score:52 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELENYHTL.L..EGG.QE.D...FQSS..GAGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1448 score:48 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELETYHNL.L..EGG.QE.D...FQSS..GAGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1369_004 score:45 alignment:10M3D1M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RAL.EDL.E.DA..L....Q.GA.AKE...D.ALR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3725 score:52 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLEEEREL.L..EGG.QE.D...FQSS..GAGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2413_002 score:39 alignment:11M7D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YN.SLTLNGKKL.......VTHF~~~~~~~~~~~~~~~
>C709_013 score:45 alignment:3M1S[2,2]8M5D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.S...LTL.NNDLLKK.....NSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1491_011 score:47 alignment:4M4D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGTA....SVVSATMEVTHQ..GL~~~~~~~~~~
>C3531 score:66 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE..DFAT.YQ...PE..D..F.A...TAQ.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2493 score:47 alignment:4M1S[3,3]6M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SD.VVVAGEF...DQGS..STDKLGA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C540 score:52 alignment:1I1S[1,2]20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A GA..SGV.MM.M...GDGS..GPGK.EK...KD..Q..W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1332_015 score:111 alignment:1S[2,2]19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SA.WAW.S.AG..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_103 score:158 alignment:16M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C363_006 score:96 alignment:8M2I2M1S[1,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SSMLSSDS.GM.K.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1890_009 score:49 alignment:2I21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGL.V..SGD.HS.S...CSTS..TPGV.SF...R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C434 score:110 alignment:14M1I2M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAG.QS.FWKPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_920 score:168 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1657_009 score:108 alignment:1I4M2D10M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WAS.QW....SA..LAW.YQ.Q.KPK...E.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1149_005 score:96 alignment:21M unique:False
~~DLCSLQS.PSSLSGSL.GD.L..SRL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1121_011 score:158 alignment:18M1S[2,2]1M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSASV.GD.R..LSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1445 score:50 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKAEAESYLQSKYE.ELQLTQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2353 score:51 alignment:18M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q.GSW...W.APGSPWPWQVSL.Q..DK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C191 score:57 alignment:1I8M3D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSLGGGFSS......GG.FS.R...FGGS..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C457_012 score:51 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDVVVSSSGAQE..GSSSEKLGA~~~~
>C369 score:128 alignment:14M1I2M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.GA.QYKPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C779_003 score:51 alignment:2I6M3D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGECLLCA....Q..SGV.SS.C...MGDS..G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C310_010 score:51 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GS.GG.R...GSGG..GLGS.GG...SL..R..S.S...Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1064_004 score:60 alignment:4M3I5M1D6M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSETVSETVPSA.SDNFAAGTTKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1861_007 score:53 alignment:1I21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NL..D..L.S...DLL.AEVAKAQYEELAQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C674_006 score:126 alignment:1S[2,2]12M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SA.QGL.S.SW..LAW.GA.QYKPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C190_002 score:124 alignment:6M1I4M1S[1,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.STST..QSSD.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C781_015 score:118 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.WAW.G.TG..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C812_015 score:45 alignment:2M2D2M1S[2,2]9M1S[2,2]2M unique:False
~~~LQ..QS.SPPRQASL.PP.L..LSNT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C424 score:118 alignment:1S[2,2]12M1I2M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.QGL.S.SW..LAW.GQ.AYKPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C873_004 score:150 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.QQ.Y.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C417_006 score:121 alignment:5M1I5M1S[1,2]5M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGLAS.SM..LSSD.YQ.Q.KPK...E.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C429 score:128 alignment:14M1I2M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.GQ.AYKPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C589_006 score:148 alignment:1S[2,2]14M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPGSL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1332_014 score:120 alignment:11M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAGQYQ.Q.KLQ...N.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1482 score:110 alignment:14M1I2M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAG.QP.HWKPSGL.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C447_002 score:150 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.NY..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1708_006 score:49 alignment:17M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LDL.D.SL..LAE.VQ.R.PDE...HLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1041 score:55 alignment:3I1M1S[2,2]5M1D6M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SETVTE...TVPSA.SDDFAAGTTKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1731_004 score:55 alignment:1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NL..D..L.D...SLL.AELKAQEYEQLGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1830_003 score:49 alignment:17M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LDL.D.SL..LAE.VQ.Q.QQH...VLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1349_014 score:102 alignment:1I1S[3,3]7M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SG.SQL.S.QQ..LASVYQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1319 score:49 alignment:1I7M2D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDF...SE..F..L.S.....L.LGDLATDYHK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3608 score:47 alignment:2M1S[2,2]2D3M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQG....TLP.LLS...DTDPGHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1245_007 score:52 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.GLTLVSWGSARPCSCPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1064_020 score:123 alignment:1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SM.TGL.S.QQ..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1713_006 score:53 alignment:11M1S[1,2]5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LDL.D.SL..LAE.VAA.S.KME...DLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1703_003 score:49 alignment:12M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LDL.D.SL..LAE.VKAQ.MME...L.AQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1768_004 score:58 alignment:1I7M2D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDF...TD..F..L.S.....L.LGDLATDYHK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1074_002 score:46 alignment:1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..D..L.S...LDL.AEVKAQYEDLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1742_008 score:106 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.AWS.Q.WA..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1729_007 score:55 alignment:6M3D8M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~SGTASV.......VTGTMEVTHQGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1219_009 score:46 alignment:1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KYCADMC.S..SGV.SS.C...CGHE..GPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C574_002 score:111 alignment:1I10M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS.QGL.P.VM..LAGEYQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1701_007 score:71 alignment:1I4M1I8M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGE.DFA..TW..N..P.E...DFATPEDFATYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C566_010 score:45 alignment:5M1S[3,3]7M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VVVAGEF...DQGSK.SDT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C769_009 score:51 alignment:2I1M1S[2,2]10M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVTTV.D..SVV.AG.E...FDQG..SSKT.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1555_006 score:60 alignment:3M2D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASS.....SSY.PS.L...LQHS..GSGN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1158_008 score:44 alignment:19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LVQDHC...GVTCGAVVVAGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1569 score:43 alignment:11M1S[2,1]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLARALV...DGMVQQTLAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C958 score:40 alignment:1I5M4D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGEVDV....D..QEV.VVAGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C322_008 score:117 alignment:18M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSASS.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1120_004 score:90 alignment:2M1S[2,2]4M1I3M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.GQL.S.SSV.LAGEYQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C829_005 score:113 alignment:1S[2,2]6M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.QGL.S.SSV.LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C916_003 score:49 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GP.VY...DL..Q..L.L...LLL.QLDNAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2441 score:50 alignment:3I5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVTTSD.VVVAGEF...DQGSKDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1050 score:132 alignment:16M1S[2,2] unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSASV.GR.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C900_004 score:101 alignment:2S[2,2]4M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.GQL.S.SSV.LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C652_004 score:42 alignment:4M2D3M1D1M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~V.GE.C....LLC.AQ.SGV.S.SC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2126_002 score:77 alignment:2I8M2D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAFL.A.PSVF...PPSDEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1357 score:144 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C851_003 score:101 alignment:2S[2,2]4M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.GQL.S.SGE.LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1021_004 score:107 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGL.A.PSVFL.FPPSDEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C85_007 score:112 alignment:1D17M unique:False
~~ LQMASE.PSSLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1610_012 score:126 alignment:15M1S[3,3] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KKP...E~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C768_008 score:43 alignment:2I6M4D1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGMELLCA.....GA..SGV.SS.C...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2090 score:53 alignment:5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VVVAGEF...DQGSKDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C648_003 score:134 alignment:9M1S[2,2]7M unique:False
~~DLQMTQS.PSTVSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C621_005 score:53 alignment:4M1S[2,3]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDVVVAGEFE..DSTEEKLGA~~~~
>C644_003 score:134 alignment:2M1S[2,3]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.GGAL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1927_004 score:53 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CL.L.CVVVS.GPPVDEQLKDN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1226 score:39 alignment:5M5D3M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.L..EG..........EGS..SGGN.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C575_008 score:118 alignment:8M1I2M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SSM.LAAM.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C478_011 score:142 alignment:5M1S[1,2]12M unique:False
~~DLQMTGAS.PSSLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C684_009 score:51 alignment:1I1S[1,2]17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A GA..SGV.SS.S...MGDS..GGPT.RK...G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C817_011 score:47 alignment:3I12M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGVSS.E..TVV.AG.E...FDQG..SSKT.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C551_012 score:97 alignment:6M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QSQ.Q..W..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C720_020 score:98 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGL.A.PSVFL.FPPSDQELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1139_013 score:42 alignment:6M3D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~SGTASV.......VGSTCEVT.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2812_006 score:74 alignment:6M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTTFVG.SQL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C950_011 score:89 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.ASG.Q.QW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C355_021 score:47 alignment:2I5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTTSD.VVVAGET...MQGPHPSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3718 score:134 alignment:11M1S[2,2]5M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLGTSV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C315_027 score:52 alignment:5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VVVAGEM...DQGSKSTD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1411 score:134 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.QGL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C392_019 score:121 alignment:18M unique:False
~~DLQFTQS.PSSLSASV.NG.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C155_002 score:132 alignment:12M1S[2,2]4M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSSAV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1027_013 score:105 alignment:3I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GMDSV.S.QQ..LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C545 score:115 alignment:4M1D13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QQ..S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C399_023 score:72 alignment:6D12M unique:False
~~ .....L.SSSLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_018 score:144 alignment:18M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C779_018 score:50 alignment:1I1S[2,2]5M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQGA.G.TLP.LLS...DTDPGHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C70_008 score:44 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSGG.GS.Y...GSGH..GYGG.GS...GG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1344_005 score:46 alignment:3M1S[1,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSK.GA..SVV.SS.T...MEVT..HQGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2643 score:135 alignment:18M unique:False
~~DLQMTQS.PSSLSASV.GN.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1464_005 score:58 alignment:10M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.YQVSLMS...DVPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_832 score:51 alignment:2I5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTTSD.VVVAGEF...DQGSKDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_827 score:52 alignment:5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VVVAGEF...DQGSKSTD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1681_003 score:48 alignment:5I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGMTTSDV.VVAGEMD...GAGSKTSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C543_002 score:51 alignment:2I5M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTSTD.VVVAGEF...DQGSKDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2185 score:106 alignment:3M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.AAPSVFL.FPPESSHLF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1012 score:97 alignment:3M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.AAPSVFL.FPPSDEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_092 score:124 alignment:15M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..SGV.PS.F...R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1855_007 score:97 alignment:1I5M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASLAYL.SSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1598_016 score:105 alignment:1I2M1D12M1S[2,3] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QS.Q.L.S.SW..LAW.YQ.Q.KPVSA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1928_009 score:59 alignment:1I6M1S[2,2]1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLMGY.TF.ANLGT.KLELKRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C182 score:121 alignment:1I17M unique:False
~~NLQMDHS.PSSLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1627_019 score:97 alignment:3M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.AAPSVFL.FPPSDEQLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2854_007 score:116 alignment:5M2S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAGTTV.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3700 score:97 alignment:3M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.AAPSVFL.FPPSDEKLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2268_004 score:124 alignment:3M1S[2,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLAYASSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C333_002 score:43 alignment:1I7M4D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SASSL.G..GG.........FGGS..RG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1099_006 score:127 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.QQL.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C891_007 score:45 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.P...ATGS..GGGR.FG...TG..T..A.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C90_005 score:35 alignment:5M6D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGS.S.S..........Q.KLQ...K.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1965_006 score:76 alignment:15M1S[2,3] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T.SWV.S.QQ..LAW.YQ.Q.KPSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1497 score:100 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SWL.S.QQ..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C460_006 score:43 alignment:1I3M1D13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MADK.LLCAGASG.V..SGT.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1262_010 score:126 alignment:7M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASTV.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2456 score:136 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2210 score:50 alignment:4M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SD.VVVAGEF...DQGSKDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3727 score:43 alignment:1S[2,2]3M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTAVV..D.W..VTVTAAAA.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C373_007 score:49 alignment:11M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSANTPP.LS.SQ.AS.QLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1138_010 score:43 alignment:5M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTPSA.SDDLPSASDDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C523_005 score:60 alignment:1I9M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSL.G..GGF.SS.GG..FSGS..GSFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1542_009 score:48 alignment:2I8M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSLMS...DLPYQVSLGG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C928_003 score:124 alignment:14M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..SGV.PR.S...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1627 score:97 alignment:2I2M3I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PEDFATMTL..T..L.S...DFA.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1518_007 score:48 alignment:2I8M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSLFS...DLPYQVSLGG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1893 score:45 alignment:1I7M1S[3,2]7M unique:False
~~~~~~~DS.TVVLSMDKD.L..VPATD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3537 score:49 alignment:4M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SD.VVVAGEF...DQGSKSTD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_952 score:38 alignment:1I5M6D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGS.S.S..........E.KLE...K.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2072_005 score:115 alignment:1I2M1D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QS.Q.L.S.SW..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1325_003 score:43 alignment:1I6M7D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSGS..SSG................S...HLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1384_008 score:46 alignment:1S[2,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.SD.M..VQQTAAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1424_008 score:49 alignment:2I8M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YLQVSLMS...DVPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2709_003 score:42 alignment:15M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVLTLTPAL.Q..HPV.LS.GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C667_014 score:118 alignment:3M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLSFASSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2299_002 score:46 alignment:1S[2,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.GQ.M..VQQTLAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1351_005 score:49 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~KGLTALV.ND.M..VQQTLAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C234_011 score:45 alignment:4I2M1S[2,2]4M4D1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VCAGAGSKLLCA.....GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1683 score:42 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESRPGPLASSQA.SLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1484_004 score:44 alignment:5M1S[1,2]6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AV...CLGS..GY.D.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1893_009 score:41 alignment:10M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..LSYN.SL...TL..N...SL...TLP.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C587_004 score:83 alignment:10M1S[3,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASNT.L..AAT.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C919_010 score:42 alignment:2M2S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~SQTVSAV.GT.N..HDLDDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2106_005 score:40 alignment:6M2D7M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SALQPA..L.Q..MPV.LS.GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C829_010 score:42 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL..NTP.VRASLGT...NLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C730_011 score:41 alignment:4M1S[2,1]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.VPQVTP...TLVEVRS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1500_010 score:49 alignment:2I8M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSLMS...DLPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1447 score:85 alignment:12M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.E..LE..PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1893_014 score:81 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLPYGY.TF.GQ.GT.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C784_005 score:90 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGQVS.S.GE..LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3362 score:98 alignment:4M1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYPYTF.GQ.GT.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1478 score:118 alignment:5M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAGTSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1917_011 score:88 alignment:4M1I4M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYPYTF.GQ.SA.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C651_012 score:45 alignment:10M4D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AMDKLLCAAS.......GV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3469_002 score:51 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PEDFATVTLTLTLTYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C498_018 score:80 alignment:8M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASS..E..ELL.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C886_005 score:41 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~E.PATGTSGR.GD.S..VTAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1637_007 score:70 alignment:1I7M1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DL.A.PSVFPAFPSVDEQLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1051_003 score:107 alignment:1I5M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASLLYA.SSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1388 score:110 alignment:10M1S[3,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..KD.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2218 score:42 alignment:16M unique:False
~~~LQAGAS.LPLLSNTC.GK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C558_002 score:49 alignment:2I8M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSLFS...DLPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_682 score:48 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HNL.L..EGG.QE.D...FESS..GAGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C567_002 score:92 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LASLSSSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1856_002 score:42 alignment:2M1S[1,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GG.GL..VPALQPVL.RGL.S.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1153 score:80 alignment:4M1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYPYTF.GQ.GT.KLEKLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_006 score:128 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_035 score:116 alignment:3M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLAYASSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C190_003 score:116 alignment:10M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL.Q..GSV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C188_004 score:67 alignment:8M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYFREM.....SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2840 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T..L.S...TLL.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1310_004 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLNNQFAFSLD.SLLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C897_009 score:41 alignment:7M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLDMELM.GA..SGV.SS.C...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3521 score:43 alignment:3I4M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.SLP.LLS...DTDPGHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2346 score:49 alignment:3I7M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PYQVSLMS...DLPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C530 score:49 alignment:3I7M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PYQVSLFS...DLPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C685_015 score:102 alignment:8M1S[3,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..KD.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C666_008 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SGV.PA.R...Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1769_008 score:94 alignment:5M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T..L.T...LTL.PDDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1058 score:49 alignment:3I7M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PYQVSLMS...DVPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C635_002 score:47 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLNERPAASL.Q.ASLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_313 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2427_002 score:86 alignment:4M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DL..T..L.....TLW.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C209_009 score:46 alignment:10M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSLKQEMLCA.GA..SGV.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1025 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T..L.S...SLQ.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2742 score:90 alignment:1I4M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLLYL.SSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3648 score:43 alignment:9M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..NDLT.YL...TLNND..L.T...KLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2853 score:98 alignment:3M2S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T...VT...LTL.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C408_003 score:42 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GG..GSTP.VD...DL..D..L.D...DM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C659_006 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLDMELM.Q..SGV.SS.C...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1225_003 score:93 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SRG.PS.V...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1979_005 score:46 alignment:9M2I2M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..NDLT.KF...TLNND..L.....TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1361_006 score:47 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLFNGE.Q.ELVDLNR...DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3638 score:36 alignment:1I3M5D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSSP......AT...TPPSA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2172_002 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVDT...RPPGPWQN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2089 score:41 alignment:1I2M1S[3,3]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVVVAGEF...DQGSKSTD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C513_014 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELNRPQASSQA.SLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C116_025 score:41 alignment:5M4D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AVTVA......TVP.VTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1697_003 score:49 alignment:3I7M1S[2,2]1S[2,1]1M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PYQVSLFS...DVPYQVSLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2562 score:109 alignment:2I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASLYALSSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1052_015 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQASLPL.L..GEQ.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1241_002 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SGR.PS.V...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2977_003 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTAL..VNWVEVEVAAN~~
>C1051_011 score:47 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSNPRPLASSQS.SLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2421 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVNN...GRPNWQAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C846_024 score:46 alignment:4M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.SLP.LLS...DTDPGHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C502_005 score:45 alignment:1I10M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KD.A..MLLACGAS..GV.S.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1507 score:42 alignment:7M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..LPGQ.GS....L..D..L.S...TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C792_011 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~S.LNDQFASF.LD.R..VK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1881_007 score:39 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSGW.GS.G...WGWS..GWGN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_962 score:112 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C148_007 score:41 alignment:1I10M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGTLKDAMLCA.GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2948 score:40 alignment:2I4M2D7M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PALWPA..L.Q..SPV.LS.GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3026 score:39 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RVNVPAL..QSP.VLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1629_003 score:45 alignment:7M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELS..KSFTLDD...DL..T..L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1007_003 score:37 alignment:1I6M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PSLNGYN..SYP.SLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C104_004 score:37 alignment:1I8M3D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGS.S.SE..LK.....Q.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1894_012 score:84 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL..T..L.P...SLF.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3553 score:39 alignment:6M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.QTV.S.AVC..LAE.QE.H.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2463 score:102 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T..L.S...TLQ.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1490_006 score:44 alignment:1I3M2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTRELVGSWVEQTLAAN~~
>C2118_007 score:44 alignment:1M1S[1,2]5M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.GA..GGV.PAGR...PVYS..GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2390 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSLT.LN.GH.MT.LLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2107_006 score:39 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGK.N..VPALQPAL.QGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2706 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSLT.LN.GM.HT.LLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C119_004 score:33 alignment:3M5D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVT.......VQKDSA~~~~
>C2094 score:39 alignment:3I3M2D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLDSLL..AENL.T..SGH.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C736_009 score:58 alignment:14M unique:False
~~DLQMTQS.PPHVQTM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C744_002 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDAFLCA.Q..SGV.ME.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2083_002 score:45 alignment:7M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YAPSLL.QYSSAC.PS.L...L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1750 score:44 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D..L.D...SLL.AEVKAQYE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1763_003 score:45 alignment:4I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PYQVSL.M..CGV.PY.Q...VSLG..G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1301 score:46 alignment:1S[2,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~G.VD.E..VTLVNLLS.QR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2958_004 score:44 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TP.S..SSV.PS.S...PSSS..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C484_004 score:100 alignment:12M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAASSL.Q..SGV.PR.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C702_008 score:45 alignment:1I5M1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLETLLD...SFRPEMVK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3447 score:94 alignment:1I4M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T..L.T...LTL.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2085 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TS..T..C.S...TST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1152_003 score:84 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YLAASSL.Q..SGR.PS.V...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1068_003 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSST.CS...TS..T..P.G...VYL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2465_003 score:82 alignment:1I4M1D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EL..T..L.S....LW.PEDFATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1496 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~S.LNNQFASF.LD.R..VK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C931_011 score:44 alignment:8M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TAYCLAS.GLG.S.TA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1008_011 score:39 alignment:3M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~EPATGT.GE.R..VTAM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3280 score:83 alignment:10M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLELGKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C792_012 score:48 alignment:4M1S[1,2]3M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TAYCGLAS.GLG.S.TA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C275_016 score:45 alignment:7M1S[1,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLC.AA..SGV.SS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1919 score:40 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AAWPAL..QKP.VLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2017_004 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D..L.D...SLL.AEVKAQY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C252_020 score:83 alignment:6M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GGGR..VTLTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_413 score:68 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.VR.T...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3027_003 score:95 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T..L.S...TLL.PEDFG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_816 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VTLTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C77_012 score:95 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GN.R..VTLTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1640_007 score:54 alignment:1I3M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL..T..LPE...DFA.PEDFAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1569_009 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~V.GL.V..VGLVDRMS.G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2483 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VLTTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1079 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3571 score:40 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~LQQ.ASLPLASQ.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2166 score:39 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DT..L.T...DEL.NFLRALY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C532_002 score:39 alignment:8M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDMALAC.GA..SGV.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C488_012 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLELKVN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C528_011 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLELKRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C710_011 score:74 alignment:6M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GTGKLELKRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1408_008 score:34 alignment:6M3D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EVTVE..G...DKTF~~~~~
>C1826_008 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PALPCPAL.QPV.L.SG..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_077 score:40 alignment:1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FSSSSG.Y..GGG.SS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_401 score:41 alignment:9M2I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSGD.VP...AL..QPVL.S...GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1612 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.PA.R...Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C509_009 score:43 alignment:7M1S[1,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLDMELM.GA..SGV.SS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C536_021 score:38 alignment:1I3M2D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CGVP..AL.Q.PSVRL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_018 score:41 alignment:1I1M1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~APK...E.APKEAPKEAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C321_016 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VTLGMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_820 score:92 alignment:8M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAW.YQ.Q.KPK...E.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3476 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~QASSGSPAT.LV.R..VVL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2761_007 score:34 alignment:6M3D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~TGSASV.......VTHF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2356 score:40 alignment:1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.GC.V..VQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C280_006 score:42 alignment:5M3I4M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GS.SS.RNGCFGGS..SGGY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1604_006 score:40 alignment:1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.DD.M..VQVTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_133 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C320_004 score:68 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.AR.L...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1516_006 score:40 alignment:1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.AD.M..VQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C668_011 score:71 alignment:6M1I4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GTGKLELGKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_309 score:92 alignment:10M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.PR.S...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1077 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VTLNMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_433 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPSWV.PS.S...VPGS..WPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_922 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSDK.DL...QP..V..L.S...GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C226_012 score:74 alignment:6M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.V..RTLNMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2391 score:40 alignment:1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTALV.SD.M..VQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3281 score:68 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLEKLRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2526 score:38 alignment:1S[2,2]2M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGP.AWTLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C281_024 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSLL.EKGLDQKK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C632_004 score:35 alignment:5M1S[3,2]1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHSL.Q..DK..T.G...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1199 score:39 alignment:1I1S[2,2]2M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSLEASLAETEGR
>Combined_1263 score:43 alignment:2I1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VPGTQ.VS.V..VDLTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1074 score:96 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C584_013 score:40 alignment:8M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLCA.GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C231_005 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LRPEPSLSL.E.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2406 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ATCPAL.QPV.L.SG..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_818 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLEKLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C460_004 score:35 alignment:3M1D8M unique:False
~~~LQP.ER.PSSLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C522_013 score:40 alignment:8M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLAC.GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C961_002 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASRLL.VDWVEQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C629_002 score:37 alignment:8M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDAMLCG.AA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C116_018 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EF.DQ.GS.SSELKQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C45_002 score:73 alignment:2I4M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AMAL.YQ.K.QPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2572_006 score:75 alignment:4M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYPYTF.GQ.GT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1139 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GA.R..PFLTC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_955 score:87 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C241_020 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E...P.ATGTLNYFAH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_950 score:84 alignment:10M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGV.PR.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_948 score:84 alignment:7M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AW.YQ.Q.KPK...E.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2823_006 score:78 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..T..L.S...SLQ.PEDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2557_006 score:56 alignment:6M1I2M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYP.YFTGQ.SA.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2849 score:58 alignment:4M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV..D.R..KELTC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C223_008 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.S..RLLTC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1717_016 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSASV.GD.S..LRL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C237_030 score:49 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GDSGG.PL.G...HGGS..GS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1006 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ERT.DL...QP..V..L.S...GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C394_007 score:48 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NVELDPELQKVKRS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C585_012 score:39 alignment:1I1S[2,2]2M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSLEASLAETERG
>Combined_1136 score:96 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AW.YQ.Q.KPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C904_005 score:36 alignment:1I4M1S[3,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EPSL.Q..DK.GT.H...FF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1867 score:39 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NVELDPELQKVSRK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2596 score:40 alignment:1I1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AQGP.W.TLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C278_014 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.V..KELTC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1423_007 score:84 alignment:9M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASSL.Q..SGVFPS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1638 score:86 alignment:7M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..SLLTC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C31_013 score:74 alignment:5M1S[2,2]3M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YQ.Q.KPK...E.APKVT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1588_011 score:45 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NS..LTGT.LS...NL..T..L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C659_013 score:42 alignment:1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTLTSASSR.P..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2597 score:40 alignment:1I7M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDMALCA.GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C678_018 score:79 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F.GQ.GT.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2119 score:40 alignment:3M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NG.AWTLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2619_002 score:76 alignment:2M1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.GQL.S.SW..LAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C40_025 score:39 alignment:2I7M2D2M unique:False
~~~~~~~~~QASSGSPSV....R..V~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1173_008 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSL.L..RGL.PA.T...L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C785_013 score:88 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~R...FSGS..GSGT.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2399_003 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~APMPALQAFLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1444_013 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FLPPKGPGKDTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3071 score:37 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.P...ATGT..GSRT.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C839_013 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AAVTAYCYAD..SL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1684_009 score:60 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGN.DL...TL..T..L.S...LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C526_014 score:49 alignment:7M1I4M unique:False
~~DLQPSSSSPSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3244 score:40 alignment:3M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.S...LTL.DNDLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C473_010 score:61 alignment:11M unique:False
~~DLQCSLS.PSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1927_005 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNVPALQPVL.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C861_009 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TCHAV.LLP.G.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C457_013 score:49 alignment:7M1I4M unique:False
~~DLQVSSSSPSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C776_008 score:76 alignment:6M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.LKELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1098 score:32 alignment:4M1D6M unique:False
~~DLQE.QH.MQSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3710 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNW.Q.TLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C300_005 score:79 alignment:11M unique:False
~~DLQMGQS.PSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2674_006 score:70 alignment:1M1S[3,3]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AG.SQL.S.SW..LAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3354 score:67 alignment:6M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GSQKLELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_896 score:76 alignment:2M1S[2,2]7M unique:False
~~DLMQTQS.PSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3190 score:33 alignment:1S[2,1]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVTVQDKTG..F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C932_009 score:39 alignment:7M2I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GG.GKVVSGT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C46_019 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AVTVATVPL..SR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2362_005 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSSVV.YH.F..VF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C113_003 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.AEAESLYQKS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3103 score:34 alignment:8M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTL..SVP.VTLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1180_011 score:50 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..D..L.S...DLL.AEVK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C766_011 score:50 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NL..D..L.S...DLL.AEVK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2480_006 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNW.E.TLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_892 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~K.AMDLLCAGAS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3731 score:37 alignment:6M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T.LN...DN..L...SL...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C432_008 score:40 alignment:2I9M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ANTPTRPAS.QA.SL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C26_003 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVGTAHPDEES
>C333_003 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.ER.L..VSGT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_144 score:34 alignment:4M1S[3,3]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KACL.P.SASDD.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C853_005 score:34 alignment:11M unique:False
~~DLTVGQN.KSLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_138 score:88 alignment:11M unique:False
~~DLQMTQS.PSSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C427_003 score:78 alignment:7M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..SLLT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2875 score:61 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.DV.R..GTLT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_877 score:35 alignment:3M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DG.AWTLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C351_004 score:41 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~GFSSGSAVV.SN.R..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C60_007 score:36 alignment:4M2D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.KL..KGEML~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C359_004 score:38 alignment:2I7M1I4M unique:False
~~~~~~~~~GFSSGSAVVSGG.R..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2100_008 score:41 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL...TL..T..L.Y...NSL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_959 score:88 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C748_022 score:67 alignment:4M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLYPYTF.GQ.GT.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1500 score:37 alignment:1I2M1S[1,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DAFLGSFLYEYSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2096_013 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NQ.W.TLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1459 score:40 alignment:1I2M1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..D...SL...DLL.AEVK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C189_022 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KRAL.A.PAATL.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1251 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~TAAE.ND.F..VTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2116_003 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~ALV.GQ.M..VQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1654 score:88 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VTLT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2791_002 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SW..LAS.GQ.L.AW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C630_002 score:40 alignment:1I7M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDMALAC.GA..SGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3708 score:40 alignment:3I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..T..L.W...KLL.VTHF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3681 score:78 alignment:4M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.AS.KLELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2322 score:43 alignment:8M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLL..SSP.VTLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1657 score:53 alignment:10M unique:False
~~DLQMTQS.KDY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1838 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D..L.S...RLL.NEMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1539 score:30 alignment:5M1S[3,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VVVQEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C380_002 score:32 alignment:1I5M2D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTASL.A...SFL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1967 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNT.A.LLYCGLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C356_020 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FL.PPSKDEQL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1896 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D..L.S...RLL.NERM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C71_022 score:38 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSL.H..TGG.TS.R...Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2057 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GR...FSYS..YSFA.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_506 score:34 alignment:1S[2,1]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVTVQDKSA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C47_018 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~QASS.GS.P..RTLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1439_004 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~LDS.LDSLLAEV.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C641_003 score:39 alignment:5I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WDKLLSC.Q..SGV.SS.C...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1836 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.AGL.N.LQ..PAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C968_016 score:41 alignment:2M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NN.T.ALYCLLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2707 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~PSAPSASD.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1034 score:52 alignment:1I1S[3,3]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SG.SQL.A.SW..LAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2451 score:33 alignment:6M2D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN...NL..T..L......LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2965 score:32 alignment:2M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NN.T.ALLCYLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_111 score:37 alignment:1S[2,1]1M1S[2,2]1M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSLQDSKAF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2181 score:46 alignment:6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DD...DL..T..L.....TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C32_019 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.SNTNEYMKY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1908_009 score:42 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PSVNRLL.A.PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1722 score:52 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN.DL...TL..T..L.S...LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C512_007 score:31 alignment:1I1M1S[2,2]2M2D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TKTGL.A...SFL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C695_011 score:33 alignment:2S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~VTTGW.GL.R..YT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1228_006 score:56 alignment:1S[2,2]5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LS.Q..SGV.PR.S...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1732 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~QASS.GS.P..ATLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1080 score:71 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GQ.GT.KLELKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C104_025 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.T...ASGL..GSTA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1944 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLTDNAY.CGL.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1491 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LVDQLT...EFAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C100_003 score:38 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FSS.S..SGY.PT.R...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2397_004 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.S...TLL.PEDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2239_005 score:71 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.S...TLN.PEDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_242 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPW.SLLNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1101_009 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ARL.A.TLVNMG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3353 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAW.YQ.Q.KPE...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1122_008 score:68 alignment:7M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.Q..SGV.PR.S...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C127_019 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.SNTDEYMKY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C41_018 score:38 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSTL.S..SNV.AS.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2516 score:46 alignment:6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN...DL..T..L.....TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_167 score:54 alignment:7M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN...DL..T..L.SL..TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1017_013 score:79 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~GSASV.GD.R..VTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C604_003 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSTAASFL.K..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3314 score:42 alignment:2I3M1S[3,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSL.Q..DK.AS.G...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1211_002 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLL.DLDQAMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1252 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.S...GLL.YEETR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C358_016 score:70 alignment:8M1S[2,3] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAW.YQ.Q.KPSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C177_008 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~STS.T..PGV.FS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1430_010 score:34 alignment:1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VT.AV..LNW.VQ.Q~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C297_003 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KKSLNSFSQTV~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1083 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SASV.GD.R..VTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C95_002 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~QSASQ.PD.R..QLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1651 score:37 alignment:4M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.KL..KGEM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_995 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCQQYNLYP.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1338_008 score:39 alignment:2I7M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL...TL..Y..N.S...LTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C513_005 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LVNQLT...EFAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1071_013 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C716_017 score:53 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.GKGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C203_025 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.A..SGL.GS.T...AS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2112_007 score:37 alignment:1S[2,1]1M1S[2,2]1M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSLEDSKAF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3325 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.S...SLQ.PEDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3407 score:33 alignment:4M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L.V...T...PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3222 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLLGVVT.QG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3146 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~V.GD.W..VQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1924_012 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS..GSGE.RE...PL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C466_015 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASSS.T..PGV.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2652_004 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYAASSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1761_008 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSPS..GHVV.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C872_015 score:59 alignment:4I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGLMSA.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1083_011 score:29 alignment:2M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.Q...GV.VT.H...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1227 score:35 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.L..EGE.ES.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1241 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~LSLSTSG.YQ.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1331 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LASYL.D..SLV.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1005_018 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GQ.GT.KLELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C794_018 score:63 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KLG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3264 score:37 alignment:1I1S[1,2]1M2D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGLA...A.PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1050_012 score:43 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GPSSF.Q..GQV.PS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3284 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGLSTAASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3352 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PSSF.Q..GQV.PS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C306_008 score:33 alignment:5M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALSYLDSLLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3128 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VFP.FAPEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1210_002 score:35 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PATLLRPAT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1034_015 score:43 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSL.D..SGP.PS.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1310_012 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GKLLSTAASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C363_003 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KASL.T.ASFS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1595_006 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAL.NN...DL..T..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1014 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...MA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2151_002 score:42 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QCQYNLYP.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2918_005 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSLT.LN...SL..T..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C123_016 score:35 alignment:4M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSTASVASTA~~
>C334_010 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WTLL.QEQSAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3202 score:25 alignment:4M3D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FYPE...LF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1638_003 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GAESSYP.SLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2166 score:35 alignment:5M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVT...QG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2026_012 score:71 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSLLYAASSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1386_006 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASD.VVAGEEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2530 score:33 alignment:3M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NG.AWTLVGLV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_291 score:52 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL...TL..T..L.S...LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C494_008 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLLTSAASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2175 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...GM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C504_002 score:33 alignment:2M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D.RN.VTLTLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C761_007 score:33 alignment:2M1S[1,2]1M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AC.GAG.SL.VS..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3342 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVSG.VHCGVTT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C222_022 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~SRTSS.FSCLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2570 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...MS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C129_012 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LCAASLV.S..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2259 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSTAASFL.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_157 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...AM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_879 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~VVSAAH.GD.R..DC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_960 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN.R..VTLTLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3426 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ATGT.GT.RLEGM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C133_024 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP...ATGTKQM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_998 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...WK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C515_017 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VTSGKF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1397_009 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...QA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_736 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.VGL.V.SW..LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_943 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LS...DTDPGHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1061 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NEDWHLNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C360_002 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VKLTTAAS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C527_013 score:34 alignment:6M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DD...NL..T..L.....TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2905_003 score:42 alignment:1M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DYFPEAFTV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C749_018 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KASL.K.PATL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3077_002 score:34 alignment:3M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.Q.L.D.HW..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C441_015 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GKGLSTAASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C381_023 score:40 alignment:5M2I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~R...GTGSRLGTGT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C560_015 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.Q..SGV.PS.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3088 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNT.A.LLYCLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2953 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~QASS.GS.P..ATL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2459_004 score:60 alignment:3M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLAYASSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C324_010 score:31 alignment:3M1S[3,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.Q..DK.GT.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C71_017 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~QASSGSPSV.VR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C63_015 score:58 alignment:3M3I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KPEAPAK.APKSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3049 score:35 alignment:4M1S[2,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSTASGLSTA~~
>Combined_2409 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...SM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C311_020 score:60 alignment:7M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.Q..SGV.PR.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_447 score:30 alignment:1I3M1S[3,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSL.Q..DK.GT.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C786_011 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.VKYGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C606_007 score:38 alignment:6M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN...DL..T..L.....TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C307_019 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSASV.GD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1973 score:31 alignment:1S[3,2]4M1S[1,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LNTVQLAVA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_308 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.GT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C168_025 score:33 alignment:3I1S[2,1]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVTQVTVQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C63_004 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSPATSL.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_311 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLSTAASFL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_470 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGVLS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2448_002 score:46 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AWA.A.PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_353 score:52 alignment:2M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.QG.GT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_235 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1712 score:40 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AADK.A.KLVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C198_028 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AST.A.ASKF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3382 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.QGL.S.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3381 score:35 alignment:3M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q..SR..PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_269 score:29 alignment:4M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KATL.P.AQF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C459_008 score:45 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KAG.WGL.S.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2831_003 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..T..L.D...DNL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2623 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~FPLSATASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_944 score:30 alignment:1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~VVTATN.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2121 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.VGL.V.SW..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2769 score:34 alignment:3I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HFDS...TLL.NENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2527 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WQTLVGLVS...W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2827 score:37 alignment:1I3M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTL..DD.L.N...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_609 score:34 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NVELDPELQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1154_009 score:34 alignment:5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AASRPS.LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C114_019 score:40 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~DLTASQ.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2641 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q..SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1683_006 score:36 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN..D..L.L...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C985_003 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KATSL.A..SFL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_538 score:45 alignment:2I5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.SL..TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C201_015 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVSAA..GSGS.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1220_011 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~TLV.GD.G..HTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3182 score:48 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.L...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1829_013 score:36 alignment:2I5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLTL..T..L.DN..DLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2295 score:37 alignment:3M2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..DNNL.L...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2343 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN...DL..T..L.M...L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C386_009 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVSP.PKPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2105_004 score:40 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ND.DL...TL..T..L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1270 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~QLDSLV.GE.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1606 score:37 alignment:2I4M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.....TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3257 score:54 alignment:2M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.NA.GT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1322 score:35 alignment:3I5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKEAAESLYQ..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C62_012 score:35 alignment:3I5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTEAAESLYQ..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1014_006 score:39 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FYT.LLELKVE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_968 score:63 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RASL.A.PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C621_004 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RNDV...TL..T..L.L...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2532 score:35 alignment:1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~VVTASQ.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1697 score:41 alignment:5M3I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TV..T..L.SYDLTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C362_006 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~K.A.TLKGLM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1084 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NRDV...TL..T..L.L...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C70_009 score:37 alignment:5M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHSL.Q..DK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2209 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LVTL..T..P.V...TLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C755_009 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVTRE..GYTM~~~~~~~~~
>Combined_015 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSLSV.AR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2544_006 score:45 alignment:2I5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.S...LTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2244_007 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~GMTQL.QQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3157 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAL.VGL.V.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1620_010 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~AMTQV.QQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1008_012 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSLSTAASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C670_015 score:54 alignment:4M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.GQ.SA.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1126_010 score:52 alignment:3M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASLRA.PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C191_024 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~GLTANT.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1144_008 score:36 alignment:1S[2,1]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVTVQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1432_011 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KT.TGL.A.SF..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C715_012 score:46 alignment:2M1S[3,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TF.AG.NT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1561_009 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.S.TA..LAS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C783_013 score:53 alignment:1I2M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTF.NA.GT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1105_012 score:46 alignment:1M1S[3,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q..DK.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_319 score:39 alignment:4M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..T..L.EL..TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2307 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~LATV.TP.R..V~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1657_014 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QYLSRP.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C251_018 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DL...TK..T..L.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C790_004 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKASTL.A..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C61_018 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.MW.GT.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1164 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTWK..GSF~~~~~~~~~~
>C190_012 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDK.A.KLVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C726_009 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGV.QW...TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_957 score:56 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGV.PS.R...F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C135_003 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.KLHTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_982 score:44 alignment:3M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.AAPSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2051 score:46 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EL..T..L.L...TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2086_011 score:37 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LASL.R.PSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C808_005 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LALLCLLT...K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1143_010 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..N..L.K...GLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1223 score:33 alignment:7M unique:False
~~ELQQTQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3316 score:46 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS.QGL.Q.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C741_004 score:33 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LEAAWTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1575 score:41 alignment:1I4M3I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T..L.SYDLTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3388 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~W..LGW.LQ.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_488 score:35 alignment:4M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..T..L.ML..TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3001 score:32 alignment:1I4M1S[1,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTAYCGLAS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3402 score:33 alignment:7M unique:False
~~ELQLTQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1046_011 score:37 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLVTLVS...D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1572_010 score:40 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL..T..L.L...TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C909_012 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.PQDHAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3401 score:28 alignment:3M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SCQLSCK~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3214 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~GLATV.TP.R..V~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C396_011 score:33 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ANNTLLY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3387 score:38 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLLYLAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3192 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AEF.VE.VT.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_498 score:35 alignment:2I4M3I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..L.EHDPTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3112 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TKL.PAVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3304 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGL..Y..L.E...QLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1247_010 score:38 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PKASL.L.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C416_019 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDGLFRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_703 score:33 alignment:5M3I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VCLPSASDDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2291_002 score:39 alignment:3I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSDSSYL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1149 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLASTL.A..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_985 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FSLL.SLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1225 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.APPER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C215_013 score:25 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EM..LAR.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_039 score:36 alignment:3I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QFSSSYL.SR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C680_014 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PA.TLRVL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C19_007 score:30 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTLNMR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3288 score:37 alignment:2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KQWGL.S.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_579 score:28 alignment:2I3M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSL.Q..DK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1377_015 score:46 alignment:2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WQPE...K.APK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3020_002 score:33 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FYAAPEL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_526 score:37 alignment:2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL...TL..T..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C18_010 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~LASQ.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1392_011 score:37 alignment:2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GYLAASSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_880 score:48 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTLTCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1767 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLENKLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2640 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSSR.Q..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C577_016 score:28 alignment:2I3M1S[3,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSL.Q..KD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_768 score:36 alignment:3I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGAWGL.S.SW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3279 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.A.GKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3341 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FPP...K.GPK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2053 score:25 alignment:1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MELRYA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C191_017 score:33 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KYGE.GT.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C562_017 score:30 alignment:1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MK.W.TLV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3274 score:31 alignment:4I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FPFVA.PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2588 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL...TL..T~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Template Sequence

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISTLLPEDFATYYCQQYNSYPTFGQGTKLEIKGQPKASLAPSVFLFPPEDEHLFANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS

Recombined Template REC-0-4_002

Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence (TXT)

Preview

Sequence Consensus Overview

Sequence Consensus Overview (TSV)

Preview

Variant Graph

Higher Order Variant Graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence?BargraphThe depth of coverage reported is the sum of all positional scores for that position. This is reported with the same position numbering as the consensus sequence.

Bargraph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence (TSV)

Preview

Scores

Length

Score

Matches

Unique Score

Unique Matches

Order

Alignment

Reads Alignment (FASTA)

Preview

Combined_015

Combined_018

Combined_006

Combined_039

C369

Combined_077

Combined_035

C191

Combined_1445

C434

C1074_002

Combined_103

C530

C545

C63_004

C155_002

Combined_1388

C188_004

Combined_920

C190_002

C558_002

C190_003

C424

Combined_092

Combined_1411

C429

Combined_880

C45_002

C182

C447_002

C574_002

Combined_1497

C135_003

Combined_1712

Combined_111

Combined_133

Combined_138

Combined_144

Combined_319

Combined_291

Combined_167

C1615

C90_005

Combined_353

C380_002

Combined_157

C958

Combined_498

Combined_235

Combined_242

Combined_470

Combined_269

Combined_1149

Combined_311

C1041

C1919

Depth of Coverage of the Consensus Sequence